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使用国产大模型完成单细胞自动注释
api
服务
模型
配置
数据
哥伦比亚大学梅尔曼公共卫生学院（Columbia University Mailman School of Public Health）的 Wenpin Hou 和杜克大学医学院（Duke University School of Medicine）的 Zhicheng Ji 证明，大语言模型 GPT-4 可以在单细胞 RNA 测序分析中使用标记基因信息准确注释细胞类型。
生信技能树
2024-05-31
198
0
批量安装一系列github上面的R包
github
api
https
com
tar
ConsensusTME DoubletFinder EPIC MCPcounter SCENIC SCEVAN SCopeLoomR VISION copykat cpbnplot depmap ggforestplot immunedeconv jjAnno mMCPcounter presto scMetabolism spatstat.core tgutil xCell yaGST
生信技能树
2023-09-19
519
0
生物信息学权威期刊Bioinformatics发文量最大的是谁
api
bioinformatics
key
公众号
统计
然后又看到了目前位于德国的顾祖光公众号发布的蛮有意思的探索，使用了pubmedR这个包，统计具体的某个杂志的文章的作者发文量情况：
生信技能树
2023-09-04
264
0
KEGG数据库的rest API(附带R语言小技巧)
数据库
api
发现感兴趣的KEGG ID居然不在KEGG.db包里面，比如： hsa05034 Alcoholism hsa05030 Cocaine addiction 导致下面的代码失效： library(KEGG.db) ls("package:KEGG.db") cellcycle_genes=KEGGPATHID2EXTID[['hsa04110']] cytokine_genes=KEGGPATHID2EXTID[['hsa04060']] KEGGPATHID2EXTID[['hsa05034']] KE
生信技能树
2018-03-29
1.9K
0
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【纪录片】中国数据库前世今生
穿越半个世纪，探寻中国数据库50年的发展历程
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