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纯粹靠单细胞转录组数据是很难区分CD4和CD8阳性T细胞
云服务器
数据分析
cell
数据
索引
我这里就不摘抄代码给大家了，官方文档很详细，https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html ，内容很简单而且步骤很清晰：
生信技能树
2023-11-23
1.3K
0
是否有必要对癌症病人的血液采样做单细胞转录组呢
数据挖掘
云服务器
服务器
数据
线程
文章是利用10X Genomics 平台对60例食管癌组织和4例癌旁正常组织标本进行了scRNA-seq分析，在上面的GSE160269页面可以看到详情，而且作者预先分选了免疫细胞和非免疫细胞，两个部分的样品去做单细胞，第一层次降维聚类分群如下所示：
生信技能树
2023-11-18
262
1
成为完整的生信工程师必须补全Linux技能
数据分析
linux
云服务器
windows
tcp/ip
如果这里面确实没有你需要的NGS技术，你需要做的仍然是看完我这些视频，搞清楚我是如何学习一个ngs技术的，然后把这个技能迁移到你自己的ngs数据。你会发现，万变不离其宗，本质上都是Linux能力，如何在服务器里面配置和管理软件，如何看各个软件说明书文档。
生信技能树
2022-07-26
860
0
把你的shiny网页工具部署在云服务器
云服务器
http
r 语言
我们课题组有一份油菜的核心种质资源，前几年经重测序之后已经发表了。但是课题组后面很多的项目都基于这份核心种质资源，实验室成员常常需要检索分析某些基因的特定SNP，所以我在自学了一段时间的Shiny之后就尝试着搭建了一个Shiny app并利用Shiny-server部署在课题组的服务器上，但是由于我开发的这个Shiny app本来就打开比较慢，加上很多时候服务器负荷运行，导致Shiny app打开速度就更慢了，有的时候甚至加载时间过长直接打不开。恰巧我紧跟生信技能树推文更新，了解到可以搞个云服务器来部署Shiny应用。
生信技能树
2020-07-21
9.9K
0
为什么一个python报错不影响hisat2的运行呢
python
云服务器
conda
na
但是使用它把测序数据fastq文件比对到参考基因组的fasta文件的时候，发现运行日志里面有一个很有趣的报错：
生信技能树
2020-03-17
841
0
在Ubuntu下安装旧版seurat
云服务器
https
ubuntu
http
网络安全
这里首推华为云：https://www.huaweicloud.com/pricing.html#/ecs
生信技能树
2019-07-30
2.1K
0
SSH的一些稀奇古怪的报错
云服务器
这次我没有去谷歌搜索就想到了解决方法，很明显报错解释的很清楚，是我的 /home/jianmingzeng/.ssh/known_hosts 文件里面之前记录的云服务器指纹跟现在的指纹变动了，但是重新安装系统只是把系统指纹变动了，并没有变化IP，而文件记录的是IP对应指纹，所以只需要删除那一条记录即可。
生信技能树
2018-12-05
2.1K
0
防止ssh登录服务器的掉线
云服务器
因为云服务器是我自己的，而要给十几个新手使用，所以我应该使用root权限来选择修改sshd_config文件里面的服务端参数，这样才能做到一次修改，终身受益！！！
生信技能树
2018-12-05
2.2K
0
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