首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布

生信技能树

专栏成员
1974
文章
3977351
阅读量
1167
订阅数
纯粹靠单细胞转录组数据是很难区分CD4和CD8阳性T细胞
我这里就不摘抄代码给大家了,官方文档很详细,https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html ,内容很简单而且步骤很清晰:
生信技能树
2023-11-23
1.3K0
是否有必要对癌症病人的血液采样做单细胞转录组呢
文章是利用10X Genomics 平台对60例食管癌组织和4例癌旁正常组织标本进行了scRNA-seq分析,在上面的GSE160269页面可以看到详情,而且作者预先分选了免疫细胞和非免疫细胞,两个部分的样品去做单细胞,第一层次降维聚类分群如下所示:
生信技能树
2023-11-18
2621
成为完整的生信工程师必须补全Linux技能
如果这里面确实没有你需要的NGS技术,你需要做的仍然是看完我这些视频,搞清楚我是如何学习一个ngs技术的,然后把这个技能迁移到你自己的ngs数据。你会发现,万变不离其宗,本质上都是Linux能力,如何在服务器里面配置和管理软件,如何看各个软件说明书文档。
生信技能树
2022-07-26
8600
把你的shiny网页工具部署在云服务器
我们课题组有一份油菜的核心种质资源,前几年经重测序之后已经发表了。但是课题组后面很多的项目都基于这份核心种质资源,实验室成员常常需要检索分析某些基因的特定SNP,所以我在自学了一段时间的Shiny之后就尝试着搭建了一个Shiny app并利用Shiny-server部署在课题组的服务器上,但是由于我开发的这个Shiny app本来就打开比较慢,加上很多时候服务器负荷运行,导致Shiny app打开速度就更慢了,有的时候甚至加载时间过长直接打不开。恰巧我紧跟生信技能树推文更新,了解到可以搞个云服务器来部署Shiny应用。
生信技能树
2020-07-21
9.9K0
为什么一个python报错不影响hisat2的运行呢
但是使用它把测序数据fastq文件比对到参考基因组的fasta文件的时候,发现运行日志里面有一个很有趣的报错:
生信技能树
2020-03-17
8410
在Ubuntu下安装旧版seurat
这里首推华为云:https://www.huaweicloud.com/pricing.html#/ecs
生信技能树
2019-07-30
2.1K0
SSH的一些稀奇古怪的报错
这次我没有去谷歌搜索就想到了解决方法,很明显报错解释的很清楚,是我的 /home/jianmingzeng/.ssh/known_hosts 文件里面之前记录的云服务器指纹跟现在的指纹变动了,但是重新安装系统只是把系统指纹变动了,并没有变化IP,而文件记录的是IP对应指纹,所以只需要删除那一条记录即可。
生信技能树
2018-12-05
2.1K0
防止ssh登录服务器的掉线
因为云服务器是我自己的,而要给十几个新手使用,所以我应该使用root权限来选择修改sshd_config文件里面的服务端参数,这样才能做到一次修改,终身受益!!!
生信技能树
2018-12-05
2.2K0
没有更多了
社区活动
【纪录片】中国数据库前世今生
穿越半个世纪,探寻中国数据库50年的发展历程
Python精品学习库
代码在线跑,知识轻松学
博客搬家 | 分享价值百万资源包
自行/邀约他人一键搬运博客,速成社区影响力并领取好礼
技术创作特训营·精选知识专栏
往期视频·千货材料·成员作品 最新动态
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档