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预后建模绕不开的lasso cox回归
线性回归
正则表达式
serverless
回归我们并不陌生，线性回归和最小二乘法，逻辑回归和最大似然法，这些都是我们耳熟能详的事物，在生物信息学中的应用也比较广泛, 回归中经常出现两类问题，欠拟合和过拟合。
生信修炼手册
2022-06-09
2.4K
0
机器学习专题
编程算法
聚类算法
scikit-learn
分类算法
线性回归
随着人工智能的火热，机器学习和深度学习技术再一次进入了大众的视野。python的scikit-learn模块专注于机器学习领域，提供了数据集构建，数据预处理，模型算法，效果评估等各个环节的接口，是入门机器学习的最佳模块。
生信修炼手册
2021-07-06
322
0
线性回归与最小二乘法
线性回归
scikit-learn
机器学习
神经网络
深度学习
x轴表示自变量x的值，y轴表示因变量y的值，图中的蓝色线条就代表它们之间的回归模型，在该模型中，因为只有1个自变量x,所以称之为一元线性回归，公式如下
生信修炼手册
2021-02-09
810
0
基于正则化的回归：岭回归和套索回归
编程算法
正则表达式
线性回归
api
在多元线性回归中，多个变量之间可能存在多重共线性，所谓多重，就是一个变量与多个变量之间都存在线性相关。首先来看下多重共线性对回归模型的影响，假设一下回归模型
生信修炼手册
2021-02-09
1.1K
0
使用局部加权线性回归解决非线性数据的拟合问题
线性回归
编程算法
对于回归而言，有线性模型和非线性模型两大模型，从名字中的线性和非线性也可以直观的看出其对应的使用场景，但是在实际分析中，线性模型作为最简单直观的模型，是我们分析的首选模型，无论数据是否符合线性，肯定都会第一时间使用线性模型来拟合看看效果。
生信修炼手册
2021-02-08
1.7K
0
逻辑回归:建立在回归基础上的一种分类模型
线性回归
监督学习
机器学习
神经网络
深度学习
机器学习有3大类算法，回归，分类和聚类，其中回归和分类属于监督学习，而聚类则属于非监督学习。线性回归和逻辑回归是机器学习中最为基础，最广为人知的模型。
生信修炼手册
2021-02-08
1K
0
为你的数据添加置信区间
线性回归
在数据可视化时，除了展示数据的某个具体指，其置信区间也具有非常重要的参考意义，下图是一个典型的线性回归的拟合结果
生信修炼手册
2020-08-20
953
0
孟德尔随机化研究中评估因果效应大小的方法
线性回归
编程算法
html
https
网络安全
孟德尔随机化研究借助遗传变异这一工具变量，来评估暴露因素与结局变量之间的因果效用。为了准确评估因果效应的大小，有多种方法相继被发明。本文重点看下其中常用的两种方法。
生信修炼手册
2020-05-07
1.7K
0
eQTL:连接突变与基因表达的桥梁
线性回归
在高等生物中，很多的重要性状都为数量形状，比如农作物的产量，人类复杂疾病（高血液，糖尿病)等等。对于这些数量性状而言，往往受到多个基因的调控作用。为了更好的开展复杂性状的遗传学研究，挖掘调控复杂性状的相关基因，QTL技术应运而生。
生信修炼手册
2019-12-19
1.8K
0
LDSC:连锁不平衡回归分析
https
网络安全
线性回归
简称LDSR或者LDSC, 在维基百科中，对该技术进行了简单介绍。通过GWAS分析可以识别到与表型相关的SNP位点，然而严格来讲这个结果并不一定真实客观的描述遗传因素对表型的效应，因为其结果是由以下两个因素共同构成的
生信修炼手册
2019-12-19
6K
1
用R进行Lasso regression回归分析
线性回归
正则表达式
编程算法
glmnet是由斯坦福大学的统计学家们开发的一款R包，用于在传统的广义线性回归模型的基础上添加正则项，以有效解决过拟合的问题，支持线性回归，逻辑回归，泊松回归，cox回归等多种回归模型，链接如下
生信修炼手册
2019-12-19
3.6K
0
GWAS中的Gene-Gene Interactions如何分析？看这里
线性回归
case
官方文档
在遗传学中，当两个基因相互作用然后导致对应性状的出现，说明两个基因间存在相互作用。在之前的文章中，介绍了很多的基因相互作用模型，列表如下
生信修炼手册
2019-12-19
861
0
GWAS大家都知道，Gene-Based GWAS你了解吗？
线性回归
GWAS称之为全基因组关联分析，传统意义上的GWAS针对单个SNP位点进行分析，来寻找与疾病或者性状相关联的SNP位点。在过去的几十年，依托高通量基因分型技术的快速发展，GWAS广泛应用于很多复杂疾病和性状的研究中，取得了不错的进展。
生信修炼手册
2019-12-19
2.3K
0
逻辑回归or线性回归，傻傻分不清楚
线性回归
编程算法
线性回归作为一种常用的关联分析工具，其功能强大，解释度高，但是其缺点也是很明显的。其只适用于处理连续型的变量，无法处理离散型的变量，比如对于case/control的实验设计，患病与否的临床信息，线性回归就无能无力了，此时我们就需要另外一种方法-逻辑回归。
生信修炼手册
2019-12-19
2.3K
0
线性回归的这些细节，你都搞明白了吗？
线性回归
编程算法
回归分析是一种广泛使用的统计工具，利用已有的实验数据，通过一个方程来定量的描述变量之间的关系，其中的变量可以分为两类
生信修炼手册
2019-12-19
1.4K
0
多元回归分析存在多重共线性了怎么办？
编程算法
线性回归
即两个自变量之间的关系是一条直线， 称之为共线性，当三个或以上自变量之间存在共线性时，称之为多重共线性，数据公式表示如下
生信修炼手册
2019-12-17
4.9K
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