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小明的数据分析笔记本

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111
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有趣的数据可视化:R语言ggplot2包画云雨图展示不同地质时代恐龙的体长
https://www.kaggle.com/datasets/kjanjua/jurassic-park-the-exhaustive-dinosaur-dataset?resource=download
用户7010445
2024-04-22
750
R语言ggplot2折线图/散点图/作图添加水印
在小红书看到有的人直接截我公众号的图发,所以想看看能不能在图上添加水印,我搜索了一下看有没有现成的R包可以直接做这个事情。找到了一个R包 tracee
用户7010445
2024-04-15
1070
跟着Plos Genetics学数据分析:LTRpred流程注释完整的LTR(1)安装篇
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008370
用户7010445
2024-03-01
1220
跟着Plos Genetics学数据分析:LTRpred流程注释完整的LTR(2)运行示例数据
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008370
用户7010445
2024-02-23
650
跟着PNAS学数据分析:泛基因组(pan-genome)分析核心基因组可变基因组大小
https://github.com/AnimalGenomicsETH/bovine-graphs/tree/main
用户7010445
2023-12-19
1.1K1
跟着NatureEcology&Evolution学作图:R语言smplot2画云雨图
https://www.nature.com/articles/s41559-023-02253-z
用户7010445
2023-12-11
2530
泛基因组分析计算核心可变基因家族的kaks
泛基因组分析中通常会使用orthofinder去分析基因家族,将这些基因家族分为核心和可变、私有等,然后会算不同类别的基因家族的Ka/Ks的值,主要说明的问题就是核心基因家族相对比较保守
用户7010445
2023-12-11
4590
跟着Nature Genetics学作图:R语言ggplot2箱线图展示不同类别基因家族核苷酸多样性
https://doi.org/10.1038/s41588-023-01571-z
用户7010445
2023-12-05
3060
跟着Nature Ecology&Evolution学作图:R语言ggplot2世界地图/柱形图/组合图
https://www.nature.com/articles/s41559-023-02235-1
用户7010445
2023-11-30
4660
跟着Molecular Ecology学数据分析:R语言lfmm包做环境数据和变异数据的关联分析
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/mec.16788
用户7010445
2023-11-27
3510
跟着Nature Communications学数据分析:R语言LEA包做变异位点和环境数据的关联分析
https://www.nature.com/articles/s41467-022-34206-8
用户7010445
2023-11-20
2500
R语言ggplot2簇状柱形图和堆积柱形图组合到一起的效果
在一个交流群看到有人问这个图怎么实现,今天的推文我们来介绍一下如何用R预言的ggplot2实现上面这个图。
用户7010445
2023-11-16
3590
跟着Nature学作图:R语言ggplot2箱线图/散点图/patchwork包组合图
https://www.nature.com/articles/s41586-022-05349-x
用户7010445
2023-11-13
4740
跟着Nature Plants学作图:R语言ggforce做甜甜圈饼图展示基因组中转座子的比例
https://www.nature.com/articles/s41477-021-00941-x
用户7010445
2023-11-03
2570
跟着Nature Plants学作图:R语言ggplot2柱形图误差线展示不同甜橙品种柠檬酸含量
https://www.nature.com/articles/s41477-021-00941-x
用户7010445
2023-11-02
2240
跟着PNAS学数据分析:MUM&Co软件基于基因组做结构变异检测
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/10/3242/5756209?login=false
用户7010445
2023-10-20
3250
跟着PNAS学数据分析:mash基于基因组数据估计遗传距离/nj法构建进化树
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2101056118
用户7010445
2023-10-08
5220
跟着Nature Genetics学数据分析:两套单倍型与参考基因组进行比对检测变异然后结果合并
https://www.nature.com/articles/s41588-022-01043-w#code-availability
用户7010445
2023-08-23
3040
跟着Nature学数据分析:R语言peer包处理RNAseq分析的批次效应
https://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9
用户7010445
2023-08-23
7460
跟着Science学数据分析:二倍体基因组如果组装成两套单倍型基因组如何检测结构变异
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abf7117
用户7010445
2023-08-23
2060
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