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单细胞转录组实战06: pySCENIC转录因子分析（可视化）

![生信交流与合作请关注公众号@生信探索](https://files.mdnice.com/user/38387/a8e0a2ed-ea22-4f3f-924...

生信探索 2023-02-222023-02-22 09:10:01

一眨眼CellphoneDB都更新到v5啦：2025年3月25号发表在Nature Protocols(IF=13.1)

老习惯，CellphoneDB 的官网给到你，他放了三个地方，可以每个都看看，不过可以以最后一个链接为主：

生信技能树 2025-05-082025-05-08 15:27:45

数据库、path、protocols、对象、数据

单细胞实战之cellchat——入门到进阶(高级篇1）

在中级篇中已经完成了细胞亚群的细分流程，并回顾了几个重要的分析工具。接下来将进入高级篇的内容。首先将回顾最常用的细胞通讯工具之一——CellChat。在该讲中会...

凑齐六个字吧 2025-04-132025-04-13 16:35:01

数据挖掘

python单细胞学习笔记-day7

今天继续学习视频：python_day6剩余部分和python_day7视频！一口气学完吧！

生信技能树 2025-03-172025-03-17 16:51:04

视频、数据、学习笔记、python、可视化

python单细胞学习笔记-day6

https://cf.10xgenomics.com/samples/cell/pbmc3k/pbmc3k_filtered_gene_bc_matrices....

生信技能树 2025-02-052025-02-05 13:17:38

学习笔记、python、表格、镜像、数据

python单细胞学习笔记-day9(发在Science的celltypist软件注释)

在之前的conda环境中安装新的本次上课需要的几个包：（建议先不要全都安装上，很容易后面出现包导入失败，可以运行到哪个代码缺少模块再开始安装~）

生信技能树 2025-03-282025-03-28 17:04:09

model、软件、数据、学习笔记、python

做单细胞和空转必须了解的AnnData数据结构

图解如下：https://anndata.readthedocs.io/en/stable/index.html

生信技能树 2025-04-092025-04-09 11:09:09

对象、可视化、数据、数据结构、pca

IF10+空转文献复现（二）：空转聚类结果与空转切片结合

今天的学习内容为，将空转的聚类结果与空转切片结合起来，绘制带有位置的聚类图。空转的四张片子如下：

生信技能树 2025-07-292025-07-29 10:33:02

function、im、image、编码、函数

IF10+空转文献复现（四）：单细胞与空转联合MIA分析

单细胞数据来自 Shih et al PLoS ONE 13(11): e0206785， GEO编号：https://www.ncbi.nlm.nih.gov...

生信技能树 2025-08-122025-08-12 10:36:26

data、load、函数、数据、数据处理

GEO多数据集联合分析-文献复现

文献题目：基于生物信息学的新型铁死亡基因生物标志物和免疫浸润谱在糖尿病肾病中的应用Huang, Y., & Yuan, X. (2024). Novel fer...

用户11008504 2024-05-112024-05-11 12:50:11

学习笔记

个人简介

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加入社区时间：2024-07-20

个人成就

TA 很懒，什么都没有留下╮（╯＿╰）╭

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