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NAR | 整合药用植物组学平台 IMP 功能概览 1
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IMP: bridging the gap for medicinal plant genomics
生信宝典
2023-11-08
149
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速查表 | Bash cheat sheet!
linux
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bash
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bash 指令
Here, we list some basic bash syntax with a brief explanation. It is a good starting point if you are a beginner.
生信宝典
2022-01-19
226
0
推荐一个时间轴上的历史网站
网站
地图
本想着以后陪着娃学历史时做个这样的比对 这个网站看上去都实现了 体验下~~~ 📷 对照着中国和世界史 📷 时间地图 📷 关系地图 📷 https://www.allhistory.com/painting
生信宝典
2022-01-18
1.1K
0
多序列比对软件Jalview的安装及使用体验
java
网站
Jalview是一个用于多序列比对编辑、可视化和分析的免费程序。使用系统发育树和主成分分析 (PCA) 图对序列进行分析，并探索分子结构和注释。
生信宝典
2021-12-02
2.2K
0
河南农大姚文与张会勇课题组合作发表长文综述，系统总结R/Shiny在开发交互式生物学网络工具中的应用
python
数据分析
网站
河南农大姚文与张会勇课题组合作发表长文综述，系统总结R/Shiny在开发交互式生物学网络工具中的应用
生信宝典
2021-10-22
942
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R语言可视化学习笔记之ggridges包绘制山峦图
https
网络安全
html
网站
官方文档
ggridges包主要用来绘制山峦图。尤其是针对时间或者空间分布可视化具有十分好的效果。ggridges主要提供两个几何图像函数：
生信宝典
2020-09-27
2.1K
1
高通量数据中批次效应的鉴定和处理（六）- 直接校正表达矩阵
网站
批量计算
编程算法
处理批次因素最好的方式还是如前面所述将其整合到差异基因鉴定模型中，降低批次因素带来的模型残差的自由度。但一些下游分析，比如数据可视化，也需要直接移除效应影响的数据来展示，这时可以使用ComBat或removeBatchEffect函数来处理。
生信宝典
2020-08-11
1.3K
0
Weblogo |Seq logo 在线绘制工具
网站
css
seqlogo图可以直观清晰的反应序列偏好特征，每个位置出现的碱基或氨基酸类型反映了该位置序列的偏好性，每个字母的大小与该碱基在该位置上的出现频率成正相关。
生信宝典
2019-09-29
1.7K
0
DESeq2差异基因分析和批次效应移除
批量计算
网站
差异基因鉴定 基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异，最简单的标准化方式是计算 counts per million (CPM)，即原始reads count除以总reads数乘以1,000,000。 这种计算方式的缺点是容易受到极高表达且在不同样品中存在差异表达的基因的影响；这些基因的打开或关闭会影响到细胞中总的分子数目，可能导致这些基因标准化之后就不存在表达差异了，而原本没有差异的基因标准化之后却有差异了。 RPKM、FPKM和TPM是CPM按照基因或转录本长度归一化后的表达，也会受到这一影响。 ca
生信宝典
2018-06-26
6.3K
0
如果你经常用PubMed，那么这个插件将非常好用！
网站
在之前的文章『如何让PubMed自动显示最新影响因子并一键免费下载文献！』中，科研小助手为大家介绍了一款PubMed的插件PubMedy，可惜这个只支持Chrome以及Chrome内核的浏览器，对于F
生信宝典
2018-06-26
1.3K
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