在高通量测序实验中,分析计数数据的方差与均值之间的关系,并利用负二项分布模型来检测基因表达的差异。
通常会使用基因组浏览器来查看特定区域的染色质景观。整合基因组查看器有两种版本:一个是网络应用程序版本,另一个是本地桌面版本,这两种版本都很容易操作。UCSC 基...
SEACR(用于 CUT&RUN 的稀疏富集分析工具包)专为从染色质分析数据中识别峰值和富集区域而设计。这类数据通常背景信号极低(即某些区域完全没有读数覆盖),...
某些项目可能需要对比对质量分数进行更严格的过滤。本文细讨论了bowtie如何分配质量分数,并举例说明。
CUT&Tag 技术会在靠近固定酶的染色质颗粒两侧加上接头,不过染色质颗粒内部的标签化反应也有可能发生。所以,当 CUT&Tag 针对组蛋白修饰时,得到的主要是...
CUT&Tag 技术会将接头序列插入到抗体连接的 pA-Tn5 附近的 DNA 中,而插入的具体位置会受到周围 DNA 可及性的影响。因此,那些起始和结束位置完...
本系列[1] 将开展全新的CUT&Tag 数据处理和分析专栏。想要获取更多教程内容或者生信分析服务可以添加文末的学习交流群或客服QQ:941844452。
CUT&Tag 插入文库的构造,采用 Tn5 适配器和带有条形码的 PCR 引物,具体如下所示:
质量检查参考:https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/bad_secorence_f...
2025-03-03:切蛋糕的最小总开销Ⅱ。用go语言,你有一个大小为 m x n 的矩形蛋糕,需要将其切割成 1 x 1 的小块。给定两个整数 m 和 n 以...
在真核细胞的核里,DNA 上发生的所有动态活动,比如基因表达调控,都离不开一个由核小体(包括它们的化学修饰)、转录因子和相关蛋白复合物组成的染色质环境。不同的染...
苹果发布 Final Cut Pro 11 新增多项AI功能 自动抠图和自动生成字幕
通过用户提供的重分析链接,看到了参数X-axis variable manual cut设置为 0=A 1=B 2=C 3=D 4=E,这是引发错误的根源。
cut 命令用来显示行中的指定部分,删除文件中指定字段。cut 经常用来显示文件的内容,类似于 type 命令。
cut命令用于显示行中的指定部分或删除文件中的指定字段。它可以用于显示文件的内容,类似于type命令。除此之外,cut命令还可以连接两个或多个文件,并将它们的内...
现有的大模型对齐方法包括基于示例的监督微调(SFT)和基于分数反馈的强化学习(RLHF)。然而,分数只能反应当前回复的好坏程度,并不能明确指出模型的不足之处。相...
本文介绍在ArcGIS下属ArcMap软件中,通过“Cut Polygons Tool”工具,对一个面要素矢量图层加以手动分割,从而将其划分为指定形状的多个...
实际上,初看中文时,真的会搞不清楚。但一看英文,就非常清晰了,所以如果硬要说中文,我倾向于直译:
ascp(Aspera Command Line Transfer)是一种用于高速数据传输的命令行工具,由 Aspera 开发,用于在网络上传输大型数据集和文件...
Cut &Run 和 Cut & Tag的常规流程多数步骤是一致的,我的全部流程主要参考了三篇教程,在此致谢。