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百味科研芝士
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m6A结合单细胞转录组打造5分+SCI
数据结构
数据分析
大家好！今天给大家介绍一篇2022年5月发表在Journal of Translational Medicine（IF：5.531）上的一篇文章。作者对结直肠癌患者的单细胞转录组数据进行分析，分别鉴定m6A介导的TME细胞亚群并鉴定这些细胞亚群的预后价值和预测免疫治疗反应的价值。
百味科研芝士
2022-05-17
708
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8分+个体化通路活性鉴定算法开发
tcp/ip
数据分析
大家好！今天给大家介绍一篇2022年4月发表在eBioMedicine（IF:8.143）上的一篇文章。作者构建个体化通路活性鉴定方法（IPAM），可以准确进行癌症类型分类并预测癌症患者预后。
百味科研芝士
2022-05-17
588
0
在线数据库帮你搞定多组学分析
sql
数据库
数据分析
随着高通量测序技术种类的越来越多，我们经常会拿到相关样本的不同组学的数据。那拿 TCGA 的数据库而言，对于同一个患者，就检测了RNA-seq， miRNA-seq， 甲基化芯片等等多组学的数据。对于这样有多组学数据的情况，除了基本的单一组学的分析，也可以尝试着融合多个组学一起分析。所以，今天就介绍一个多组学分析的工具。OmicsAnalyst (https://www.omicsanalyst.ca/OmicsAnalyst/home.xhtml)
百味科研芝士
2021-09-03
815
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不容错过的6分+预后模型套路
数据分析
go
题目：Development of a four-gene prognostic model for clear cell renal cell carcinoma based on transcriptome analysis
百味科研芝士
2021-07-12
2.1K
0
甲基化结合免疫浸润如何打造5分+SCI
数据分析
数据库
sql
题目：NEFM DNA methylation correlates with immune infiltration and survival in breast cancer
百味科研芝士
2021-07-12
713
0
单基因免疫相关分析发7分+2区SCI
数据分析
题目：ncRNAs-mediated high expression of SEMA3F correlates with poor prognosis and tumor immune infiltration of hepatocellular carcinoma
百味科研芝士
2021-07-12
613
0
利用代谢相关基因构建列线图是如何发4分+SCI的？
数据分析
大家好！今天跟大家分享的文献是2020年9月发表在Molecular Therapy-Oncolytics（IF=4.115）杂志上的一篇文章。文章利用TGCA数据库中肺癌患者的转录组数据，使用代谢基因特征建立预测模型，预测患者的生存时间。构建列线图预测患者的3年和5年生存率。
百味科研芝士
2021-01-06
988
0
缺氧相关基因预测模型这样分析依旧可以发2区4分+SCI
数据分析
大家好，这次给大家分享得文献是A hypoxia-related signature for clinically predicting diagnosis, prognosis and immune microenvironment of hepatocellular carcinoma patients，2020年9月发表在Journal of Translational Medicine杂志上，影响因子4.124。文章主要是寻找肝细胞癌诊断、预后和复发的特征基因并构建预测模型，所用方法比较常见但篇幅很长！
百味科研芝士
2020-11-13
935
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Graphpad官网刚刚升级了！听说，新功能吊打R语言........
数据分析
编程算法
数据结构
GraphPad Prism是一款高效易用的科研绘图工具，集生物统计、曲线拟合和科技绘图于一体，还可用于Windows和Mac操作系统，在生物学以及社会和物理科学界得到广泛使用。
百味科研芝士
2020-11-05
3.2K
0
TCGA在线神器！这个全新网页帮你零代码搞定特定基因家族分析！
express
数据分析
生物信息学分析对实验是重要的辅助和补充。癌症基因组图谱（TCGA）是肿瘤研究中重要的数据库，然而因为其数据集规模较大，复杂度较高，下载数据进行分析困难较多。在做TCGA数据分析时，GEPIA等网页工具给操作带了极大的便利，能够使分析绘图更加快速简单。今天我们介绍一款新的TCGA网页神器，有助于大家更为便捷，高效的进行数据分析和画图。
百味科研芝士
2020-11-04
2.7K
0
3分+多组学分析识别与胃癌肿瘤免疫相关的分子特征
数据分析
小编今天解读的这篇文章是2020年发表在Annals of Translational Medicine杂志（IF：3.297），题目为Identification of molecular features correlating with tumor immunity in gastric cancer by multi-omics data analysis。作者识别了与GC免疫显著相关的分子特征可能是有用的生物标记物，可用于对免疫疗法有反应的GC患者进行分层，或在GC中促进抗肿瘤免疫和免疫疗法反应的潜在干预目标。
百味科研芝士
2020-10-09
517
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这篇只有两个Figure的10分+SCI是靠什么取胜的？
数据分析
今天和大家分享的是2020年6月发表在CLINICAL CANCER RESEARCH （IF=10.107） 上的一篇文章，作者分析了前列腺癌中BRCA1/2突变与HRD间关系，以帮助筛选出可能对PARP抑制剂或铂类药物治疗有效的病人。
百味科研芝士
2020-09-22
1.4K
0
单基因如何干湿结合发5分+泛癌分析
数据分析
编程算法
今天和大家分享的是2020年1月发表在EBioMedicine（IF：5.736）上的一篇文章，作者通过单因素、多因素cox回归分析、KM生存分析等途径建立了TP63亚型的表达对TCGA-膀胱癌（BLCA）及泛癌的差异预后效应，同时首次构建出了TP63在BLCA中的完整亚型列表。
百味科研芝士
2020-07-09
1.4K
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ceRNA如何在膀胱癌中做出新花样?
go
数据分析
数据库
sql
小伙伴们好呀！今天和大家分享的是一月份发表在Cancer Cell Int(IF:4.175)杂志上的一篇文章。作者利用公共数据库挖掘膀胱癌中的ceRNA机制，建立了一个膀胱癌相关的ceRNA调控网络。
百味科研芝士
2020-07-09
600
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非肿瘤单基因纯生信文章如何发3分+
数据分析
硬件开发
大家好，今天和大家分享的是今年3月份发表在Shock(IF：3.083)的一篇非肿瘤生信文章，“S1PR1-associated Molecular Signature Predicts Survival in Patients with Sepsis ”，本文作者通过生信手段去分析败血症患者的预后与已知预后相关基因S1PR1的相关基因的关系，快来学习一下吧！
百味科研芝士
2020-06-24
2.4K
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Follow这些步骤，临床数据也能妙笔生花！
网站
数据分析
编程算法
对于临床医生而言，我们能接触到的更多的其实是临床数据。目前关于数据分析有一个专门的术语叫做“数据科学”。今天就给大家介绍一个数据分析流程的网站，利用这个网站来简单的了解一下数据分析流程。
百味科研芝士
2020-06-24
526
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6分+纯生信：基于免疫浸润对多癌种进行化疗获益分析
数据分析
今天分享的是2020年4月份发表于Cancers的一篇文章，影响因子6.162。标题是Pan-Cancer Analysis of Radiotherapy Benefits and Immune Infiltration in Multiple Human Cancers。文章是针对多癌种对化疗获益的分析，主要是从免疫浸润差异入手来进行研究。最后集中在对BRCA数据集的分析，获得了3个化疗相关特征基因，并用ROC曲线对其诊断价值进行评价。
百味科研芝士
2020-06-09
1.1K
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23分多组学文献：胃肠腺癌的分子比较分析
数据分析
数据结构
今天和大家分享一篇发表在cancer cell上的文章，影响因子23.916，这是一篇多组学分析文章。
百味科研芝士
2020-06-09
2.1K
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网络药理学期刊推荐
数据分析
这本药理学杂志创办于1873年，是德国实验临床药理学和毒理学学会（DGPT）的官方期刊。杂志刊登文章的重点是关于药物作用和化合物毒性的重要信息。因此虽说是一本毒理学相关的杂志，它的范围可扩展到实验和临床药理学以及毒理学的所有领域，包括神经药理学和心血管药理学以及作用细胞、生化和分子水平上的药物作用的研究。
百味科研芝士
2020-05-20
2.1K
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三大软件帮你解决PDF文件的全部痛点
数据分析
文件存储
PDF文件的重要性毋庸置疑，国自然上传需要PDF文件，很多SCI投稿需要上传PDF文件，哪怕换个电脑打开为了避免格式混乱，你也需要用到PDF文件。可以说PDF文件贯穿你的科研生涯，可见它是多么重要。
百味科研芝士
2020-04-30
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