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#R 语言

自由软件编程语言与操作环境,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘

单细胞数据复现-肺癌文章代码复现8

小胡子刺猬

单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648

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单细胞转录组之Seurat包全流程-数据过滤、降维分群及可视化

青青青山

对于之前从CellRanger得到的比对结果,读取sample/outs/filtered_feature_bc_matrix文件夹下的三个文件:barcode...

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单细胞数据复现-肺癌文章代码复现7

小胡子刺猬

单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648

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单细胞数据复现-肺癌文章代码复现6

小胡子刺猬

单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648

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单细胞数据复现-肺癌文章代码复现5

小胡子刺猬

单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648

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单细胞数据分析-R语言对分群结果的top基因循环做富集分析

小胡子刺猬

在单细胞的数据分析当中,每个亚群的top基因是十分重要的,因为这一部分的基因主要是代表了这一亚群的高表达基因,为了后面的分群鉴定,主要是通过seurat的fin...

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单细胞数据复现-肺癌文章代码复现4

小胡子刺猬

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单细胞专栏-如何给orig.ident换名字

小胡子刺猬

​由于上游的分析是公司给做的,但是发现我在跟他们说样本名字的时候发错了,想后面自己更改一下每个orig.ident和groups的名字,百度了一下有没有类似问题...

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单细胞数据复现-肺癌文章代码复现3

小胡子刺猬

单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1:https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648

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单细胞数据复现-肺癌文章代码复现2

小胡子刺猬

昨天是先对数据初步的质量进行过滤,今天是对过滤后的数据进行标准化和后面开始进行分群。其实还是比较流程的,但是还是有些东西是很细节的,是一些学习的片段的推文比不了...

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单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1

小胡子刺猬

由于老板给定的研究方向是做单细胞组学的,跟以往的组学都是不太一样的,导致学的相当吃力,同时网上的一部分的代码是分段的,有的时候学习不到相关的分析的思路,因此看到...

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单细胞-SeuratR包安装第二弹安装完成

小胡子刺猬

昨天是把能编译好的g++环境和stringi安装上了,也跟了那个帖子,但是发现rgeos还是装不上,请教了师兄,师兄说我的R是用的Conda装的,所以后面装包的...

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集齐多种功能的团队协作软件!

物立

做技术 管理的童鞋,往往会陷入这样一种困境:疲于奔命,到处救火填坑,沟通推进,却挤不出时间思考对团队和项目来说真正重要的事情。

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R语言学习--R for Data Science - 2.2 Aesthetic mappings

R小白

上节学习了ggplot2的基础作图,并掌握了基本的作图模板。但是每次作图只有两个变量映射到了图形中,如下图:

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R语言学习--R for Data Science - 2.1 ggplot2

R小白

上一节介绍了跟练所需的软件,R包和数据,这节开始跟练书中的第一块内容:数据可视化。

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R语言学习--R for Data Science(一)

R小白

刚开始接触R语言是因为单细胞数据分析的需要,那时完全是零基础,学习过程是边抄别人的代码,边理解这些代码的含义,遇到了比较多的坑,包括软件安装,环境配置,R包安装...

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R 基因表达量与生存分析

用户8370880

Survival Analysis Basics - Easy Guides - Wiki - STHDA

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R Markdown的一个坑:文件夹不能有中文

贰师兄TEN

在RStudio中使用支持R Mardown格式的R Notebook,.rmd代码文件所在目录不能有中文名,否则Preview功能无法正常使用,预览文件中不会...

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R语言tryCatch使用方法:判断Warning和Error

邓飞

R中判断warning和error状态的函数,我没有找到。一个玩Java的同事说,try.....catch多经典的方法,你怎么不用呢?

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R语言dataframe数据转换

爱学习的小明明

df_melt<-reshape2::melt(df,id.vars="x",variable.name="year",value.name="value")

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