自由软件编程语言与操作环境,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648
对于之前从CellRanger得到的比对结果,读取sample/outs/filtered_feature_bc_matrix文件夹下的三个文件:barcode...
在单细胞的数据分析当中,每个亚群的top基因是十分重要的,因为这一部分的基因主要是代表了这一亚群的高表达基因,为了后面的分群鉴定,主要是通过seurat的fin...
由于上游的分析是公司给做的,但是发现我在跟他们说样本名字的时候发错了,想后面自己更改一下每个orig.ident和groups的名字,百度了一下有没有类似问题...
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1:https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648
昨天是先对数据初步的质量进行过滤,今天是对过滤后的数据进行标准化和后面开始进行分群。其实还是比较流程的,但是还是有些东西是很细节的,是一些学习的片段的推文比不了...
由于老板给定的研究方向是做单细胞组学的,跟以往的组学都是不太一样的,导致学的相当吃力,同时网上的一部分的代码是分段的,有的时候学习不到相关的分析的思路,因此看到...
昨天是把能编译好的g++环境和stringi安装上了,也跟了那个帖子,但是发现rgeos还是装不上,请教了师兄,师兄说我的R是用的Conda装的,所以后面装包的...
做技术 管理的童鞋,往往会陷入这样一种困境:疲于奔命,到处救火填坑,沟通推进,却挤不出时间思考对团队和项目来说真正重要的事情。
上节学习了ggplot2的基础作图,并掌握了基本的作图模板。但是每次作图只有两个变量映射到了图形中,如下图:
上一节介绍了跟练所需的软件,R包和数据,这节开始跟练书中的第一块内容:数据可视化。
刚开始接触R语言是因为单细胞数据分析的需要,那时完全是零基础,学习过程是边抄别人的代码,边理解这些代码的含义,遇到了比较多的坑,包括软件安装,环境配置,R包安装...
Survival Analysis Basics - Easy Guides - Wiki - STHDA
在RStudio中使用支持R Mardown格式的R Notebook,.rmd代码文件所在目录不能有中文名,否则Preview功能无法正常使用,预览文件中不会...
R中判断warning和error状态的函数,我没有找到。一个玩Java的同事说,try.....catch多经典的方法,你怎么不用呢?
df_melt<-reshape2::melt(df,id.vars="x",variable.name="year",value.name="value")
扫码关注云+社区
领取腾讯云代金券