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C

CFS

参见 文件存储

COS

参见 对象存储

存储桶

存储桶(Bucket),指对象存储 COS 中用于存储对象的存储空间。

  • 在智能媒资托管中,一个存储桶中可以存储多个对象。存储桶名由用户自定义的字符串和系统自动生成的数字串用中划线连接而成,以保证该存储桶全球唯一。
  • 在数据万象中,数据万象是基于对象存储 COS 的数据处理平台,您需要绑定或新建 COS 存储桶才可使用数据万象相关功能。一个存储桶中可以存储多个对象。存储桶名称由用户自定义的字符串和系统自动生成的数字串用中划线连接而成,以保证该存储桶全球唯一。更多详细信息,请参见 存储桶概述

Cromwell

Cromwell 是 Broad Institute 开发的 WDL 工作流语言的任务管理引擎。腾讯健康组学平台通过 Cromwell 将 WDL 描述的 workflow 运行在容器中。更多 Cromwell 介绍,可查看 Cromwell 介绍文档

D

对象

对象存储 COS 中存储的基本单元。

对象存储

对象存储(Cloud Object Storage,COS)是腾讯云提供的一种存储海量文件的分布式存储服务,具有高扩展性、低成本、可靠安全等优点。通过控制台、API、SDK 和工具等多样化方式,用户可简单、快速地接入 COS,进行多格式文件的上传、下载和管理,实现海量数据存储和管理。

E

EKS

参见 弹性容器服务

G

工具

工具是生物信息软件的镜像封装,软件可以是第三方发布的软件,像 FastQC、BWA 等;也可以是一个简单的 shell 命令,比如 sort、awk 等,也可以是生物信息人员自己编写的脚本。

工作流语言

工作流语言(Workflow Description Language),是 Broad Institute 开发的“human readable and writable”定义组织任务与工作流的一种语言,主要面向生物信息数据分析领域。目前推荐使用的版本是1.0。WDL 工作流的基本组成部分包括 workflow 和 task。
简单来说,workflow 是工作流的入口,包含整体的输入和输出,在 workflow 中可以调用 (call) task。task 包含输入 (input),命令 (command),运行参数 (runtime) 以及输出 (output) 几个部分。其中 input 部分对应 call task 的时候传入的 input。一个 task 的output 可以作为另一个 task 的 input。这样层层连接就成为了一个完整的工作流。
一些 WDL 相关的常用资源:

工作项目

用户在腾讯健康组学平台上创建的一个工作环境,用于资源隔离和控制,可管理样本表格、生信应用流程、和运行查看任务等。

J

镜像仓库

镜像仓库(Repository)用于存放 Docker 镜像。单个镜像仓库可对应单个具体的 Docker 应用,并托管该应用的不同版本,即对应仓库内不同版本的容器镜像(docker image),用于部署容器服务。

R

容器镜像服务

腾讯云容器镜像服务(Tencent Container Registry,TCR)是腾讯云提供的容器镜像云端托管服务,支持 Docker 镜像、Helm Chart 存储分发及镜像安全扫描,为企业级客户提供了细颗粒度的访问权限管理和网络访问控制。支持镜像全球同步及触发器,可满足企业级客户拓展全球业务及使用容器 CI/CD 工作流的需求。支持具有上千节点的大规模容器集群并发拉取 GB 级大镜像,可保障业务的极速部署。 通过使用容器镜像服务,您不再需要自建并维护镜像托管服务,即可在云上享有安全高效的镜像托管、分发服务,并可与腾讯云容器服务 TKE 结合使用,获得容器上云的顺畅体验。

S

SecretKey

SecretId 和 SecretKey 合称为云 API 密钥,是用户访问腾讯云 API 进行身份验证时需要用到的安全凭证。SecretKey 是用于加密签名字符串和服务器端验证签名字符串的密钥。一个 APPID 可以创建多个云 API 密钥。

SecretId

SecretId 和 SecretKey 合称为云 API 密钥,是用户访问腾讯云 API 进行身份验证时需要用到的安全凭证。SecretId 用于标识 API 调用者身份。一个 APPID 可以创建多个云 API 密钥。

实例 Pod

由相关的一个或多个容器构成一个实例,这些容器共享相同的存储和网络空间。Pod是资源对象模型中由用户创建或部署的最小资源对象模型,也是运行容器应用的资源对象,其他的资源对象都是用来支撑或扩展Pod对象的功能。

T

弹性容器服务

弹性容器服务(ElasticKubernetesService,EKS)是腾讯云容器服务推出的无须用户购买节点即可部署工作负载的服务模式。EKS 完全兼容原生 Kubernetes,支持使用原生方式购买及管理资源,按照容器真实使用的资源量计费。EKS 还扩展支持腾讯云的存储及网络等产品,同时确保用户容器的安全隔离,开箱即用。

TCR

参见 容器镜像服务

W

WDL

参见 工作流语言

文件存储

文件存储(Cloud File Storage,CFS)提供了可扩展的共享文件存储服务,可与腾讯云的 CVM 等服务搭配使用。CFS 提供了标准的 NFS 文件系统访问协议,为多个 CVM 实例提供共享的数据源,支持弹性容量和性能的扩展,现有应用无需修改即可挂载使用,是一种高可用、高可靠的分布式文件系统,适合于大数据分析、媒体处理和内容管理等场景。

Y

应用 Pipeline

数据分析的应用流程,通常指使用流程描述语言编写的标准化的、参数化的生物信息分析流程,清晰的定义了分析的输入输出、运行环境和软件依赖,例如 WGS 的分析流程。腾讯健康组学平台使用 WDL 流程语言进行应用编辑。

Z

组学平台环境

指应用运行所需云资源的集合,包含了若干台云服务器、对象存储、文件存储等资源。