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生信宝典

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ChatGPT已打破图灵测试,新的测试方法在路上
全球最佳的人工智能系统可以通过难度较大的考试,写出有人类感染力的文章,还能和人类一样流畅地聊天,以至于很多人无法辨别它们的输出是否为人类所写。那么,它们不能做什么呢?解决简单的视觉逻辑谜题。
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2023-09-12
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AlphaFold的极限:高中生揭示人工智能在生物信息学挑战中的缺陷
人工智能程序AlphaFold (AlphaFold2开源了,不是土豪也不会编程的你怎么蹭一波?),通过预测蛋白质结构解决了结构生物信息学的核心问题。部分AlphaFold迷们声称“该程序已经掌握了终极蛋白质物理学,其工作能力已超越了最初的设计”。事实真是如此吗?Skoltech Bio的研究团队让 AlphaFold 预测单个突变对蛋白质稳定性的影响,结果与实验结果相矛盾,这表明该人工智能并非结构生物信息学的万能良药。该研究发表在《PLOS One》杂志。
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2023-08-30
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NBT | 微生物研究所王军组在AI赋能挖掘微生物组功能多肽方面获得新进展
抗生素耐药是现代医学面临的严峻挑战之一,在近几十年来,产生抗生素耐药性的病原微生物持续增加,每年在全球范围内耐药菌引发感染造成的死亡人数达到70万人。抗菌肽(AMPs)作为解决抗生素耐药性的候选方案之一,具有不易产生抗药性、作用快速等优势,同时因为容易降解也不会对环境造成持续性污染。因此,开发出能够应对抗多重耐药菌的新药物,缓解耐药问题迫在眉睫;但传统方法筛选新药的候选分子成功率较低,亟需高通量的挖掘和筛选手段。
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2022-03-27
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王俊和尹玉新团队合作开发代谢组联合人工智能肺癌早期检测新方法
2022年2月2日,北京大学人民医院王俊院士团队和北大-清华生命科学联合中心、北京大学基础医学院尹玉新教授团队合作在Science Translational Medicine杂志上在线发表了题为“Lung cancer scRNA-seq and lipidomics reveal aberrant lipid metabolismfor early-stage diagnosis”的研究论文,应用单细胞转录组学、血浆脂质组学、机器学习和质谱成像综合分析早期肺癌的脂代谢特征,开发了一套人工智能辅助的早期肺癌代谢检测方法,并揭示了相关的分子机制。
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2022-03-27
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机器学习也可以在线做!
做生信分析,Galaxy 平台应该都不陌生,里面提供了很多在线分析流程和工具,可在线使用也可以本地部署。
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2022-03-27
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清华姚班教师劝退文:读博,你真的想好了吗?
先简单介绍一下我的背景。我本科在University of Wisconsin-Madison,然后去CMU念了个PhD,主要研究数据库方向。目前回国在清华IIIS(姚班)做助理教授,并且 cofound 了 Singularity Data.
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2022-01-18
3890
机器学习爱好者必读的入门指南
本指南适用于任何对机器学习(Machine Learning,ML)感兴趣但不知道从何开始的人。(莫烦Python机器学习)
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2019-10-21
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三人成虎,概率却不足十分之五?
你打算去西雅图旅游,但不确定是否会下雨。你打电话给三个在西雅图居住但彼此不认识的朋友询问。你的每个朋友都有2/3的可能告诉你真实情况,也有1/3的可能他们会搞砸。询问后所有的朋友都告诉你会下雨。
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2019-05-09
1.6K0
整合QC质控结果的利器——MultiQC
NGS技术的进步催生了新的实验设计、分析类型和极高通量测序数据的生成。对于这些数据的质量评估,每一步分析结果的评估是后续结果可信度的衡量和保障。不少生信工具都可以给样品生成一个评估结果,如FastQC、Qualimap 和RSeQC等 (39个转录组分析工具,120种组合评估)。但是这时又出现了一个难题,那就是几乎所有的质控工具都是针对单个样本生成一个报告,这就要求用户自己去逐一查找各个QC结果,这无疑是个十分耗时、重复又复杂的事,而且还不能快速看出所有样本的异同。
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2018-12-24
3K0
在线浏览器,在线PS,在线AI,在线编程 ...
现在越来越习惯使用在线工具,拿来即用,用完即走。只要有网,在哪都可以用。比如我们推出的在线绘图 (http://www.ehbio.com/ImageGP)已经成为非批量作图的首选,可以绘制常见生物信息图形。
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2018-08-01
17.4K0
IGV基因组浏览器可视化高通量测序数据
IGV是本地浏览测序数据功能最为强大的基因组浏览器,支持多种不同类型的输入格式和不同的显示方式,如峰图、线图、柱状图、Sashimi-plot。同时还可以配合bedtools使用。 新版的Windows IGV分发包中包含了Java运行环境,点击链接http://data.broadinstitute.org/igv/projects/downloads/IGV_Win_2.3.93.zip即可下载,解压后,点击igv.bat文件即可启动。 若启动失败,使用记事本打开并编辑igv.bat文件,在文件的最后新
生信宝典
2018-03-30
1.8K0
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穿越半个世纪,探寻中国数据库50年的发展历程
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