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天啦,啥肿瘤有如此高比例的树突细胞
隐私
微信
数据分析
数据
统计
如下所示是的降维聚类分群和命名,很明显的可以看到髓系免疫细胞里面的巨噬细胞和树突细胞的比例是有问题的,而且那些高表达量基因明明是单核细胞的并不是树突细胞的 :
生信技能树
2024-06-08
127
0
2024年04月_生信入门班_微信群答疑笔记
笔记
镜像
入门
软件
微信
忽略提示。先从第一行开始,一行行run,每run一行观察左下角窗口的输出信息,没有关键词 error 且返回一个大于号 > 再run下一行
生信技能树
2024-06-08
126
0
2024年03月_生信入门班_微信群答疑笔记
入门
软件
微信
笔记
服务器
上课有给练习服务器账号,后续会通知。第三周上课会讲到服务器相关的知识,到时候你先用我们提供的服务器账号进行练习,等上完课后,再用自己的账号去处理真实项目数据。
生信技能树
2024-06-08
94
0
从微信聊天记录复制粘贴的Linux代码为什么运行失败?
微信
编辑器
视频
linux
正则表达式
这个小插曲不仅引起了我的好奇心,也激发了我探索和解析背后原因的欲望。在这篇文章中,我将与大家分享我对这个问题的研究过程、发现的原因,以及如何j解决。这个经历提醒我们,在日常工作中,一些看似简单的操作也可能隐藏着意想不到的bug,值得我们深入探讨和理解。
生信技能树
2024-04-13
263
0
论单细胞数据造假的可能性
微信
https
函数
数据
算法
比如大多数人就是做了两分组的六个样品,十万块钱左右的项目。但是呢,因为金主们的外行,所以很多公司走标准流程的过程中其实可以完全不做单细胞的建库测序出真实数据,可以凭空捏造数据。。。。
生信技能树
2024-03-25
145
0
2023-12(数据挖掘马拉松)答疑汇编
数据
数据挖掘
微信
软件
实践
需要安装一下缺的包。而且你这个电脑用户名里面有中文,也是一个麻烦的事情,如果搞不定就联系助教哦
生信技能树
2024-01-11
196
0
换一个分析策略会导致文章的全部论点都得推倒重来吗
微信
数据分析
可视化
数据
图表
这3个阶段就是天然的分组啦, 每个分组是3个病人取样后做单细胞转录组,其中有两个病人的样品会同时送去做空间单细胞,所以可以看到如下所示的实验设计流程图:
生信技能树
2023-10-25
281
0
是的,不同版本的cellranger软件对10x技术单细胞定量结果可以相差5倍以上
数据挖掘
微信
软件
数据
学习笔记
这个问题,在我们的各种微信交流群确实是看到过,恰好有一个小伙伴也在数据集(PRJNA777911)进行了测试,这个是汕头大学那边课题组的2021的食管癌单细胞成果,是发表在NC的文章:《Integrated single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of esophageal squamous cell carcinoma microenvironment》
生信技能树
2023-09-04
370
0
我当然理解初学者可以不懂,但是感觉有些底层知识点没必要在微信群提问
微信
工作
函数
计算机
脚本
在R中,你可以使用.libPaths()函数来查看R包的安装路径。这个函数会返回一个字符串向量,其中包含了所有R包的安装路径。默认情况下,第一个路径是你的个人R库的路径,其他的路径则是系统级别的R库路径。
生信技能树
2023-09-04
172
0
用ChatGPT做生信?只不过是帮助懒人查官方文档
官方文档
微信
我看了看朋友们秀出来的跟ChatGPT的生物信息学相关对话,起初还以为是很高大上。比如:
生信技能树
2023-02-27
646
0
警告!你的微信聊天窗口复制粘贴的代码有风险!
微信
linux
编程算法
助教最近很高产啊,前两天刚投稿了:全新购买的的Linux云服务器居然无法使用ssh登陆
生信技能树
2022-06-08
1.8K
0
把转录组测序的FPKM矩阵当做是芯片表达量处理真的好吗
硬件开发
数据挖掘
微信
https
网络安全
是一个铁死亡策略的非肿瘤数据挖掘文章,标题是:《Bioinformatics Identification of Ferroptosis-Related Biomarkers and Therapeutic Compounds in Ischemic Stroke》,链接是:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fneur.2021.745240/full
生信技能树
2022-03-03
677
0
适当清理你的微信聊天文件
微信
windows
linux
git
这样就有一个问题,它的默认C盘是一个固态硬盘就区区500G空间,但是我微信等很多软件都是默认在C盘自己的用户下面的文档文件夹里面找位置存放资料。
生信技能树
2022-03-03
1.4K
0
很多事情不一定有答案(但是可以有交流渠道)
https
网络安全
linux
微信
云直播
不过,最近几年我的教程都是conda和aspera高速下载啦,但即使是这样,仍然是很多人反馈下载失败,有一些是Linux命令不熟悉,自己把代码写错,有一些是数据库下载源的问题,部分数据缺失是数据库的责任,并不是你的错!还有一些是网络问题,甚至是玄学,比如前两天可以,今天就不可以,或者说前面奋战了两个星期都失败,但是今天却无缘无故下载成功了!
生信技能树
2021-01-18
1.1K
0
关于搜索,你不知道的是.....
微信
https
网络安全
编程算法
搜索引擎
做知识分享的人多如牛毛,良莠不齐,而且绝大部分人无法坚持下来,但是生信技能树不一样,坚持7年,输出1.3万票优质教程,所以大家可以直接在微信这个APP里面针对性的搜索咱们《生信技能树》的内容。一些搜索技巧见:
生信技能树
2020-09-22
470
0
尝试中国区的GitHub
https
网络安全
github
微信
git
不过,我比较懒,写代码仅仅是顺手而为,其实对代码本身并不感兴趣,编程这个东西,思维上没有挑战,太简单了,不想把时间花在上面。
生信技能树
2020-06-03
693
0
lncRNA-seq数据分析之新lncRNA鉴定和注释视频课程众筹
linux
https
网络安全
微信
不过对于其它物种,猫狗猪,甚至其它你叫不出来名字的昆虫,鱼类,这个分析策略还是蛮常见的。比如发表在Front. Genet., 18 March 2019 | https://doi.org/10.3389/fgene.2019.00196的文章
生信技能树
2020-03-17
1.9K
0
怎么样才能正确的学习生信分析呢?—从学徒做起
数据分析
硬件开发
微信
(PS : 需要排除部分根本就无心向学的,也许是没有时间,也许是畏难。总之,没有学习条件哪怕是找到我,我也无能为力哈)
生信技能树
2020-03-10
3.7K
0
FDA致病菌检测挑战赛结果发布,厦门极元科技总分排名第二
http
go
网站
微信
金融
近期,美国食品药品监督局FDA通过在线平台precisionFDA (https://precision.fda.gov) 举办了CFSAN Pathogen Detection挑战赛,目的是在宏基因组测序样本中鉴定出沙门氏菌株的分布和类型。该比赛于今年2月16号—4月26号在precisionFDA平台上举办。最终成绩在FDA网站(https://precision.fda.gov/challenges/2/view/results)上在线公布 。
生信技能树
2018-12-07
584
0
没有更多了
社区活动
【纪录片】中国数据库前世今生
穿越半个世纪,探寻中国数据库50年的发展历程
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