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python脚本根据抗病基因ID和所有基因的bed文件鉴定抗病基因簇
系统
python
脚本
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植物里的抗病基因更倾向于成簇存在，分析抗病基因家族通常也会分析成簇存在的或者单个存在的抗病基因的比例，之前想自己写脚本统计这个数据，但是怎么写代码一直没有想明白，最近看论文
用户7010445
2024-02-23
149
0
再见了Origin，这才是科研法宝，新手秒出图！
python
数据分析
机器翻译
爬虫
Python能把数据自动输出成折线图、三维图、直方图、嵌套饼图等规范高质量的图表，直观展示千辛万苦得来的研究成果，助力文章发表。
用户7010445
2023-01-06
547
0
推荐一个非常好用的文件分享神器gofile
python
https
网络安全
我试了下文件上传速度非常快，可以达到10M，下载速度也非常快，可以达到5M，不用注册，直接就可以使用，或者可以直接用邮箱登录，非常方便。不知道在国内的网络能不能使用，感兴趣的可以测试一下
用户7010445
2023-01-06
9.2K
0
跟着Molecular Plant学作图：R语言circlize包画圈图展示基因组的一些特征
python
https
网络安全
论文 A telomere-to-telomere gap-free reference genome of watermelon and its mutation library provide
用户7010445
2023-01-06
1.6K
0
总有一本适合你~分享9本和生物信息学相关的python电子书
python
(这本书没有找到pdf版本，是epub，我是使用Neat Reader这个软件打开的，这个里面都是实际的例子，很好的入门学习材料)
用户7010445
2023-01-06
456
0
学python：使用python的pysam模块统计bam文件中spliced alignment的reads的数量
python
https://sites.google.com/site/bioinformaticsremarks/bioinfo/sam-bam-format/what-is-a-cigar
用户7010445
2023-01-06
861
0
跟着Nature ecology and evolution学python：vcf文件转换成fasta文件
python
https
网络安全
linux
https://www.nature.com/articles/s41559-022-01753-8
用户7010445
2023-01-06
741
0
跟着PNAS学作图：python做花瓣图（flower plot）展示草莓泛基因组的数据
github
git
开源
python
Evolutionary history and pan-genome dynamics of strawberry (Fragaria spp.)
用户7010445
2021-12-28
869
0
跟着Nature microbiology学作图:R语言ggplot2做簇状柱形图并在坐标轴添加分组标记
数据分析
r 语言
python
数据可视化
https://github.com/plemey/SARSCoV2origins
用户7010445
2021-11-08
2.5K
0
R语言ggplot2做玫瑰图（花瓣图）的简单小例子
python
r 语言
数据分析
今天在一个交流群里看到有人问这个图如何实现？这种图叫玫瑰图或者花瓣图，如果使用R语言的ggplot2来做的话， 比较常规的实现办法是先做柱形图，然后再用极坐标，比如
用户7010445
2021-09-22
4K
0
跟着Science学画图：python的seaborn模块画下三角热图
python
数据分析
De novo assembly, annotation, and comparative analysis of 26 diverse maize genomes
用户7010445
2021-09-22
2K
0
bioconvert：各种各样的生物信息数据格式转换工具
https
网络安全
python
数据分析
内容主要来自 https://bioconvert.readthedocs.io/en/master/tutorial.html
用户7010445
2021-08-31
694
0
使用blastn鉴定lncRNA中可能是miRNA前体的序列
数据库
sql
数据分析
http
python
最近在看植物长链非编码RNA的论文，其中一个分析步骤是鉴定lncRNA中可能是属于miRNA前体的序列
用户7010445
2021-07-12
616
0
R语言GOplot画弦图展示GO富集分析的结果之如何准备自己的数据
python
r 语言
数据分析
这个是最终的结果，如果我自己拿到这个数据作图完全没有问题，但是这个推文写的内容可能是有些乱的，对于没有python基础的同学应该比较麻烦，争取花时间在研究研究，把这个脚本完善一下，写的更加具有普适性。
用户7010445
2021-05-07
2.3K
0
DnaFeaturesViewer: python里用来画基因结构的模块
github
git
开源
数据分析
python
https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/DnaFeaturesViewer
用户7010445
2021-04-21
869
0
R语言ggplot2两个离散变量画热图的简单小例子
http
python
数据集下载链接 http://userweb.eng.gla.ac.uk/umer.ijaz/bioinformatics/ecological/SPE_pitlatrine.csv
用户7010445
2021-03-15
1.3K
0
跟着Nature Medicine学python：python调用R语言的
r 语言
python
数据分析
https
这个代码以 ipynb后缀名的文件存储，我打开这个文件的方式是使用 Jupyter lab，安装好anaconda3以后jupyter lab默认就可以使用了。
用户7010445
2021-03-14
804
0
聊聊通常构建数据指标体系，告别数据初级民工
python
云直播
数据分析
金融
“没有一套合理的数据指标体系，纵然你有再多的数据，分析起来根本无从下手。”做数据分析时的你是否深有同感？
用户7010445
2021-01-22
526
0
跟着Nature microbiology学画图~堆积柱形图+箱线图以及组合图
https
网络安全
python
说明没问题,是得到了dataframe；这样：数据准备好了，作图的工具也准备好了，那么我们就开始作图：
用户7010445
2020-12-08
4.4K
0
学习python画图模块plotnine:第一步安装
python
https
matlab
numpy
https://plotnine.readthedocs.io/en/stable/index.html
用户7010445
2020-09-03
2K
0
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