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让ChatGPT编写交互式网页应用的临床预测模型
R Shiny是一种基于Web的交互式数据可视化工具,能够帮助研究人员和临床医生快速构建交互式应用程序,从而进行数据分析和可视化。
Jamesjin63
2023-03-08
1.5K0
2022-03-11
在Shiny中,reactive()是一个函数,用于创建一个响应式变量(reactive variable)。当Shiny应用程序的输入参数或状态改变时,这个响应式变量会被重新计算,并返回一个计算结果。换句话说,reactive()用于定义响应式表达式,当输入参数或状态改变时,它会自动重新计算Shiny。
Jamesjin63
2023-03-01
1.3K0
Meta分析森林图中文显示问题
Stacfamily = 'STHeitiSC-Light'或者 family="Arial Unicode MS"即可显示中文,然后我们保存
Jamesjin63
2023-01-15
4450
Python机器学习-02:模型构建
随着人工智能时代的到来,机器学习已成为解决问题的关键工具,如识别预测疾病风险等。Python是实现机器学习的热门语言之一。接下来会详细介绍机器学习如何应用到实际问题,并概括通过Python进行实际操作。
Jamesjin63
2022-11-03
4570
雷达图面积计算
雷达图表,也被称为蜘蛛图(玫瑰图),在数据的可视化时候,经常被用到,可以提示一个系统不同维度的得分情况,以判断该系统的完整性。(譬如个人在下面10个维度的得分,可以知道数学、英语、生物、音乐及运动等部分还需加强)
Jamesjin63
2022-11-03
1.1K0
R-论文三线表快速实现-update
之前介绍过一期利用 Tableone包实现三线表,最终的展现效果很好。但是有些功能不好实现。譬如OR与RR值的展示。具体操作见:R:绘制临床三线表 -https://www.jianshu.com/p/bfb038bd55cd
Jamesjin63
2022-11-03
1.9K0
机器学习Caret--R处理不平衡数据
不平衡数据集指的是数据集各个类别的样本数目相差巨大,例如2000的人群中,某疾病的发生只有100 (5%)人,那么疾病发生与不发生为 1:19。这种情况下的数据称为不平衡数据。在真实世界中,不管是二分类或三分类,不平衡数据的现象普遍存在,尤其是罕见病领域。
Jamesjin63
2022-11-03
7110
patchwork--快速掌握科研论文图片排版
在发表论文时候,经常会看到高大上的图片排列及绘制。通常我们用软件(spss+excel等)绘制好图片,都是单个figure。有时候很有必要将这些图片进行组合。一般都是PPT或者PS进行
Jamesjin63
2022-11-03
1.6K0
R语言偏态分布的回归分析
回归是我们经常遇到的模型,但是回归会根据Y因变量的类型,分成分类问题(Y是分类变量,如生存或死亡)与回归问题(Y是连续性变量,如身高体重)。
Jamesjin63
2022-11-03
1.2K0
预测三分类变量模型的ROC介绍
我们对Logistics回归很熟悉,预测变量y为二分类变量,然后对预测结果进行评估,会用到2*2 Matrix,计算灵敏度、特异度等及ROC曲线,判断模型预测准确性。
Jamesjin63
2022-11-03
9090
Caret 出现traning或者Testing 数据集准确度100%
在R 使用caret进行机器学习模型构建时候。针对二分类问题,会发现我们的预测值准确度达到100% 即,可以准确对目标进行分类。
Jamesjin63
2022-11-03
3940
在R里面根据shp文件进行点的抠图
当我们有一个图层文件时候,然后再放些采样点在该图层上,发现,某些采样点落在地图的外面,如下图所示。如果用Arcgis操作,很容易把外围的点抹去,保留图层内的点,那么如果在R里面,实现该操作呢。
Jamesjin63
2022-11-03
9810
ggplot画图:y坐标从0开始,去除x横坐标与柱状图之间的间隙
[toc] 直接看图解释 image.png 由上图,我们可以看到,1)x横坐标与柱状图有一些距离,那么现在我们要去掉这个距离。怎么办?,2)还发现,y坐标与柱状图也是有距离的。咋去除? 接下来,我们
Jamesjin63
2022-11-03
2.5K0
Part1:可解释的机器学习-XAI – eXplainable Artificial Intelligence
DALEX是一个R包,用于机器学习的可视化解释、探索、模型调试和模型预测(又名XAI -可解释的人工智能)。它为预测模型的不同方面提供了大量的可视化解释。在构建机器学习时候非常有用。目前还没有过多应用于医学领域;在这篇文章中,我们将在R中实现可解释人工智能的算法。在这里可以找到对全局和局部模型评估方法的介绍。
Jamesjin63
2022-11-03
4480
【Lesson1】R 机器学习流程及案例实现
一直在学习机器学习的项目;学的断断续续。近期需要完成一些数据建模与分析,将机器学习重新整理了一遍。这篇文章主要是介绍R数据科学中,构建机器学习模型的流程。为了更适合无基础的人快速了解整个流程框架,本文省去机器学习模型的原理及公式部分,如果需要了解,请戳 Here 。
Jamesjin63
2022-11-03
8130
ggplot2多图Panel 组合【facet_wrap() and facet_grid()】
今天就说下ggplot在绘制多图时候的一些骚操作。R里面的ggplot绘图很强大,有时候一张图可能满足不了我们的需求,需要分组展示,同时放在同一个Panel内。这时候ggplot里面的(facet_wrap() and facet_grid())[https://www.r-graph-gallery.com/ggplot2-package.html]就提供了极大的便利。 本文主要介绍:
Jamesjin63
2022-11-03
1.1K0
R矢量地图栅格化(将shapefile转换成raster)
在处理地图数据时候,经常会碰到shp与raster两种格式。通常r中应用较多的为raster栅格数据。shp文件太大,读取也不方便。逐渐被GeoJSON替代,用sf去处理与读取。 R在读取shp时候,处理,或者画图都会碰到,反应迟钝问题。所以,我们有时候会根据需要,将shp文件转成raster,不仅可视化快,还可方便数据处理与提取。shp文件转成raster主要解决以下问题:
Jamesjin63
2022-11-03
1.4K0
ggplot增设小地图(南海九段线)
用Arcgis专业作图工作制作中国地图时候,往往会添加南海九段线,其中南海九段线是因为需要保证中国土地的主权完整性。在Arcgis中操作时候,会根据标准中国地图,实现增加第二个图层,然后只截取南海部分,完成两个图层展现在同一副图中。 那么问题来了,如何在R中实现该操作? 现在绘制地图经常会用到ggplot与sf,如何实现同一副地图中,添加南海九段线呢。 主要是借助于cowplot包,可以实现两个图层的叠加。
Jamesjin63
2022-11-03
1.2K0
R数据科学-2(tidyr)
是用于清洗数据的工具,如dplyr一样,其中每一列都是变量,每一行都是观察值,并且每个单元格都包含一个值。 “ tidyr”包含用于更改数据集的形状(旋转)和层次结构(嵌套和“取消嵌套”),将深度嵌套的列表转换为矩形数据框(“矩形”)以及从字符串列中提取值的工具。它还包括用于处理缺失值(隐式和显式)的工具。
Jamesjin63
2022-11-03
8590
simon二阶段设计样本量计算
II期临床试验是确定一种药物或方案是否具有足够的临床疗效的关键,需要进行更广泛的研究和开发。 在两阶段设计中,将患者分为两组或两个阶段。 在第一阶段完成时,将进行临时分析以确定是否应进行第二阶段。 如果有疗效的患者人数大于一定数量,则进行第二阶段。 否则,相反。
Jamesjin63
2022-11-03
1.3K0
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