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百味科研芝士
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不容错过的6分+预后模型套路
数据分析
go
题目：Development of a four-gene prognostic model for clear cell renal cell carcinoma based on transcriptome analysis
百味科研芝士
2021-07-12
2.1K
0
4分+缺氧和免疫相关预后模型标准范文
go
大家好！今天跟大家分享的文献是2020年11月发表在Journal of Hepatocellular Carcinoma （IF=4.655）杂志上的一篇文章。文章利用TGCA数据库中肝细胞癌患者的转录组数据，分析并确定了患者的缺氧和免疫相关的特征并建立了预测模型，预测病人的预后状况。
百味科研芝士
2021-01-06
1.4K
0
3分+非肿瘤纯生信免疫浸润分析还可以这么做！
go
机器学习
神经网络
深度学习
人工智能
大家好，今天小编分享的是今年3月份发表在Diagnostics (Basel)(IF：3.1)的一篇非肿瘤纯生信文章，本文作者通过挖掘GEO数据库中骨关节炎相关数据集，经差异分析，用LASSO回归和支持向量机法构建预测模型筛选出标志分子，此外还分析了OA中的免疫细胞浸润情况。文章思路简单，快来学习吧！
百味科研芝士
2020-11-13
5K
0
重磅！国自然科学基金医学部（面青地）结果出炉啦！今年你中了么？
go
https
网络安全
根据《国家自然科学基金条例》、国家自然科学基金相关项目管理办法以及专家评审意见，国家自然科学基金委员会（以下简称自然科学基金委）2020年第20次委务会议决定资助医学领域面上项目4584项、青年科学基金项目4505项、地区科学基金项目917项，合计10006项。
百味科研芝士
2020-10-09
952
0
单细胞测序结合生信分析发优质的5分+文章
go
今天和大家分享的是2020年7月发表在International journal of cancer（IF：5.145)上的一篇文章，作者通过单细胞测序技术和聚类分析、功能富集分析、预后分析等多种方法探究了喉鳞状细胞癌的细胞异质性，鉴定并验证了与预后相关的几种肿瘤细胞及其标志基因。
百味科研芝士
2020-10-09
3.6K
0
不想学代码却依旧可以做生信分析的metascape 入门教程
html
go
metascape 是属于目前来说最良好的数据分析网站，他可以满足使用者目前最主流的生物信息学分析流程，例如 KEGG 通路富集、GO 功能注释、PPI 网络等。并且最重要的是画出来的图形极其的美观，几乎不需要任何的后期修饰，而且在 nature、cell 这样的大期刊发表的很多文章中的图片也是用这个网站绘制图片
百味科研芝士
2020-08-24
2.5K
0
ceRNA如何在膀胱癌中做出新花样?
go
数据分析
数据库
sql
小伙伴们好呀！今天和大家分享的是一月份发表在Cancer Cell Int(IF:4.175)杂志上的一篇文章。作者利用公共数据库挖掘膀胱癌中的ceRNA机制，建立了一个膀胱癌相关的ceRNA调控网络。
百味科研芝士
2020-07-09
600
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纯生信胃癌ceRNA再发3分+
go
网站
大家好，今天和大家分享的是一月份发表在Cellular Biochemistry(IF：3.448)杂志上的一篇文章，“Identification of downregulated circRNAs from tissue and plasma of patients with gastric cancer and construction of a circRNA‐miRNA‐mRNA network”，作者利用多种公共数据库和在线分析网站识别胃癌患者组织和血浆中下调的circRNA并构建circRNA-miRNA-mRNA网络。
百味科研芝士
2020-05-26
1.1K
0
自噬相关基因模型在非小细胞肺癌中的预后意义
go
geo
lambda
各位小伙伴们大家好，这次给大家分享的文献是Prognostic implications of autophagy-associated gene signatures in non-small cell lung cancer，2019年12月发表在Aging杂志上，影响因子5.515。文章通过对自噬相关基因表达谱进行分析，得到与临床预后相关的特征基因，结合临床特征和自噬基因特征，进而预测NSCLC患者的生存率。
百味科研芝士
2020-03-04
956
0
生信绘图，不会R？快看这个作图神器
go
生信分析现在已成为小伙伴们发表文章的标配，里面各种各样的结果展示形式炫目多彩，让人看得如痴如醉，但是让我们自己去画，却不知从何处着手，首先R语言的入门和学习就是许多生信小白的拦路虎。不过，现在许多大神和团队不断推出的在线作图网站却是方便了许多新手作图。
百味科研芝士
2020-02-14
2.5K
0
DriverDBv3：一站式解决肿瘤多组学分析的“炫酷”神器
go
na
可视化
目前，生信文章常常不再局限于单一组学分析，而是将基因表达与非编码RNA、突变、甲基化、CNV、临床数据进行整合分析，多组学分析已然成为生信分析的主流趋势。今天，为大家分享一个近期发表在“核酸”杂志上的神器——DriverDBv3，也是一个可以一站式解决肿瘤多组学分析的“炫酷”神器！
百味科研芝士
2019-12-17
1.8K
0
LnCeVar：高逼格的lncRNA相关ceRNA分析神器
go
今日，师兄说给我推荐一款神器——“LnCeVar”，我便迫不及待的上了PUBMED......
百味科研芝士
2019-11-07
1.2K
0
手把手教你学会GO富集分析和弦图绘制
go
各位科研芝士的朋友，大家好。这周我们继续分享关于数据可视化的教程，今天我们把自己的视线聚焦在富集分析上，一般大家会选择DAVID在线工具或者y叔的神包clusterProfilter来操作，不管你选择哪种富集方式，我们得到的GOterm，都需要进行可视化展示，这篇关于GOplot的教程也是大家一直碎碎念的教程，今天就分享给大家。
百味科研芝士
2019-09-19
6.1K
2
基于四个甲基化mRNA标记物的风险评分系统预测肝细胞癌患者的生存
数据库
sql
go
A four-methylated mRNA signature-based risk score system predicts survival in patients with hepatocellular carcinoma 。
百味科研芝士
2019-08-23
644
0
STRING网站+Cytoscape软件制作精美蛋白互作网络图(PPI)
编程算法
网站
go
之前小编为大家推送了利用DAVID网站进行差异基因的GO和KEGG分析，而基因功能注释后就可以寻找蛋白表达之间的关系了，在生信分析中，常常会使用STRING网站+Cytoscape软件来制作蛋白互作网络图(PPI)。今天小编奉上一部PPI制作教程，让我们一起细细咀嚼吧！
百味科研芝士
2019-05-29
42.4K
2
PubMed专题：(一）如何精准高效地进行文献搜索
数据库
sql
go
腾讯云开发者社区
文献搜索在每个科学家的日常生活中都是不变的。我们花费大部分时间来积累信息。无论是编写一个基金本子，设计/排除一个棘手的实验···这都需要我们了解领域的最新动态。其中，我们的大多数研究和文献搜索都是在线完成的。
百味科研芝士
2019-05-23
7K
0
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