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数据分析

DoubleHelix

基因芯片数据分析(一):芯片数据初探

简单地讲,基因芯片就是一系列微小特征序列的(通常是DNA探针,也可能是蛋白质)的集合,它们可以被用于定性或者定量检查样品内特异分子的成份。比如说,基因芯片可以检...

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R语言数据分析与挖掘(第六章):主成分分析(1)——主成分分析概论

在许多领域的研究与应用中,往往需要对反映事物的多个变量进行大量的观测,收集大量数据以便进行分析寻找规律。多变量大样本无疑会为研究和应用提供了丰富的信息,但也在一...

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R语言数据分析与挖掘(第六章):主成分分析(2)——案例讲解

na.action:一个函数,指定缺失数据的处理方法,若为NULL,则使用函数na.omit()删除缺失数据。

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基因芯片数据分析(八):DESeq2差异分析实战案例

基因芯片数据分析(六):DESeq2包的基本原理 我们接下来通过一个案例介绍利用edgeR进行差异分析。

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基因芯片数据分析(七):edgeR差异分析实战案例

我们接下来通过一个案例介绍利用edgeR和DESeq2包进行差异分析,本文先介绍edgeR。

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基因芯片数据分析(四):获取差异表达基因

然而对于大多数生物学工作者而言,学习和使用一种或者多种统计分析手段并不一定非常容易,这需要付出时间和努力。Bioconductor的很多软件包很好的避免了人们为...

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基因芯片数据分析(三):数据质控

基因芯片的质量控制有很多种手段,有针对每一个芯片本身的,也有针对组内差异小于组间差异的。对于Affymetrix公司提供的质量控制手段通常有:平均背景噪音(范围...

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基因芯片数据分析(二):读取芯片数据

在microarray的处理中,第一步就是读取数据。无论是自己的保存在本地的数据,还是在线保存的数据,对于不同公司的芯片可以使用不同的软件包读取。在这里,我们说...

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不会编程的同学看过来:新的GEO数据在线分析工具——BART

本地版:https://bitbucket.org/Luisa_amaral/bart

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R语言数据分析与挖掘(第四章):回归分析(2)——多元线性回归

上一篇文章中介绍了一元线性回归(R语言数据分析与挖掘(第四章):回归分析(1)——一元回归分析),然而,在实际操作中,多元性回归会更多见,因为一个响应变量会对应...

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R语言基础教程——第1章:初识R

R是统计领域广泛使用的诞生于1980年左右的S语言的一个分支。可以认为R是S语言的一种实现。而S语言是由AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析和...

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