R语言plot()函数画图时,想将几幅图画在同一页上,使用到par()函数定义一页多图。
❝最近看到一个非常好的案例来分享一下,使用igraph,ggraph等R包来自定义绘制代谢通路pathway, 原文文档链接见下方,数据可自行去官网下载。代码过...
本次使用的示例数据是Daniel van der Meulen在1585年收到的信件所组成,包括writer,source, destination和date
通常,基因集富集分析的结果(例如使用 limma::fry、singscore 或 GSEA)由一长串基因集组成。然后生物学家必须搜索这些列表,以确定新出现的主...
本文是复杂网络课的一个小作业,主要学习如何导入图数据以及如何利用igraph包绘制网络图。
单细胞即是在单个细胞水平上来考察组织生物学信息,在单细胞时代之前,人们获得组织生物学信息有两个层面:组织水平和分子水平,单细胞技术弥补了这两者之间的鸿沟。众所周...
原文链接:http://tecdat.cn/?p=18770 为了用R来处理网络数据,我们使用婚礼数据集。 > nflo=network(flo,dire...
上文Hilldiv: 便捷的计算及可视化Hill number提到了可以直接可视化qgraph。第一次见,此文简要介绍一下。
SNA社会关系网络分析中,关键的就是通过一些指标的衡量来评价网络结构稳定性、集中趋势等。主要有中心度以及中心势两大类指标。
中介中心性(Betweeness Centrality),又叫中间中心性,中间性,居间中心性等等。以下是学者们对中介中心性的解释。 中介中心性...
编者按:上个月菌群月坛,在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验,不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识,更使我手上一个关于菌根的课题有极大的启示。这么好...
igraph 是一个独立的库,底层是 C,上层有 Python 和 R 接口,主要做图和网络方面的计算,附带绘图功能。