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#igraph

R语言plot画图par(mfrow=c(1,2))实现一页多图

孙小北

R语言plot()函数画图时,想将几幅图画在同一页上,使用到par()函数定义一页多图。

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R优雅的自定义绘制代谢通路图

R语言数据分析指南

❝最近看到一个非常好的案例来分享一下,使用igraph,ggraph等R包来自定义绘制代谢通路pathway, 原文文档链接见下方,数据可自行去官网下载。代码过...

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🤠 Network | 高颜值网络可视化工具(一)

生信漫卷

本次使用的示例数据是Daniel van der Meulen在1585年收到的信件所组成,包括writer,source, destination和date

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vissE--提供不同的基因集富集分析方法!

作图丫

通常,基因集富集分析的结果(例如使用 limma::fry、singscore 或 GSEA)由一长串基因集组成。然后生物学家必须搜索这些列表,以确定新出现的主...

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igraph包——绘制网络图

庄闪闪

本文是复杂网络课的一个小作业,主要学习如何导入图数据以及如何利用igraph包绘制网络图。

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scRNA plus||单细胞结合传统测序技术之路

生信技能树jimmy

单细胞即是在单个细胞水平上来考察组织生物学信息,在单细胞时代之前,人们获得组织生物学信息有两个层面:组织水平和分子水平,单细胞技术弥补了这两者之间的鸿沟。众所周...

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R语言复杂网络分析:聚类(社区检测)和可视化

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R:qgraph初探

Listenlii-生物信息知识分享

上文Hilldiv: 便捷的计算及可视化Hill number提到了可以直接可视化qgraph。第一次见,此文简要介绍一下。

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R语言︱SNA-社会关系网络—igraph包(中心度、中心势)(二)

悟乙己

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关系网络理论︱细讲中介中心性(Betweeness Centrality)

悟乙己

中介中心性(Betweeness Centrality),又叫中间中心性,中间性,居间中心性等等。以下是学者们对中介中心性的解释。 中介中心性...

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一文学会网络分析——Co-occurrence网络图在R中的实现

生信宝典

编者按:上个月菌群月坛,在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验,不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识,更使我手上一个关于菌根的课题有极大的启示。这么好...

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igraph软件包创建图和网络(创建邻接矩阵)

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igraph 是一个独立的库,底层是 C,上层有 Python 和 R 接口,主要做图和网络方面的计算,附带绘图功能。

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SNA中:中心度及中心势诠释(不完整代码)

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