生信技能树

文章/答案/技术大牛

发布

LV1

发表了文章 6天前2025-11-20 12:06:54

致谢技能树文章：如何用单细胞数据做一个细胞亚群特异性的预后相关signature？

本研究旨在解决膀胱癌免疫治疗缺乏有效生物标志物的问题，成功开发并验证了一个基于肿瘤特异性T细胞的五基因特征（TstcSig），用于预测患者对免疫治疗的反应和预后...

生信技能树 6天前2025-11-20 12:06:55

数据、signature、队列、开发、模型

发表了文章 6天前2025-11-20 12:06:35

8个高分杂志的空转数据全套标准分析（多样本）

数据下载：http://www.cancerdiversity.asia/scCRLM

生信技能树 6天前2025-11-20 12:06:36

data、object、spatial、函数、数据

发表了文章 6天前2025-11-20 12:06:23

看了这么多文献，为什么依然做不好细胞亚群注释？

今天这个文献专门做了上皮类的一个图谱，文献标题为《A Single-Cell Atlas of the Human Healthy Airways》，该文献通过...

生信技能树 6天前2025-11-20 12:06:24

pip、table、数据、data、list

发表了文章 6天前2025-11-20 12:04:50

scATAC-seq中常见的质控图

可用片段（Usable fragment）——片段定义为测序输出中对应于基因组某一位置的序列。若进行单端测序，单个读取即为一个片段；若进行双端测序，一对读取视为...

生信技能树 6天前2025-11-20 12:04:50

数据、异常、连接、排序、事件

发表了文章 6天前2025-11-20 12:04:40

python单细胞学习（二）：使用python批量加速读取count矩阵

这篇文献是一篇极其典范的python流派的数据分析文章，集合了单细胞数据预处理，数据合并，数据整合，数据注释等工作。跨数据集和大数据量！应该有很多细节值得学习，...

生信技能树 6天前2025-11-20 12:04:40

count、函数、进程、数据、python

发表了文章 6天前2025-11-20 12:04:28

monocle2也可以用于bulk RNA-seq分析吗？

这篇文献于2021年3月26发表在NPJ Precis Oncol杂志，文献标题为：《Preoperative immune landscape predisp...

生信技能树 6天前2025-11-20 12:04:28

程序、队列、对象、数据、编码

发表了文章 6天前2025-11-20 12:04:19

三种方法解决KEGG功能富集总是出现的断网报错：cannot read from connection

非常经典的报错：这是由于功能富集分析的时候enrichKEGG函数没有接内置的通路与基因对应的关系数据包，都是从函数内部去调用KEGG网址在线去读数据的原因，遇...

生信技能树 6天前2025-11-20 12:04:19

函数、原理、数据库、connection、表格

发表了文章 6天前2025-11-20 12:02:45

python单细胞学习：（IF=48.8）顶刊杂志复现（一）

这篇文献是一篇机器典范的python流派的数据分析文章，集合了单细胞数据预处理，数据合并，数据整合，数据注释等工作。跨数据集和大数据量！应该有很多细节值得学习，...

生信技能树 6天前2025-11-20 12:02:27

大数据、迁移、基础、数据、python

发表了文章 6天前2025-11-20 12:02:10

热点基因集：中性粒细胞相关genes signatures分享

最近我们整了很多热点相关的基因集，收藏在专辑《热点基因集专辑》，已经有下面这么多了，后续还会不断地更新，欢迎关注：

生信技能树 6天前2025-11-20 12:02:11

对象、集合、数据、signature、表格

发表了文章 6天前2025-11-20 11:59:13

Nature Genetics杂志特别版单细胞marker基因气泡图

Fig2中的e图：展示的是空间转录组数据中7个细胞生态位CN1-7中每个生态位里面不同细胞亚群的DEGs基因表达气泡图。

生信技能树 6天前2025-11-20 11:59:14

数据、微信、data、marker、spatial

发表了文章 6天前2025-11-20 11:59:05

跟着Cell学习：巨噬细胞高表达肌细胞基因但是不是双包体！（看看怎么操作）

对来自15例胎儿和4例成人供体、涵盖23个器官的321份样本分选的CD45+免疫细胞进行了scRNA-seq及α/β scTCR-seq测序（图1A）：

生信技能树 6天前2025-11-20 11:59:05

cell、编码、入门、数据、数据处理

发表了文章 6天前2025-11-20 11:58:42

转录组差异分析算法显示下调，但表达值却显示上调，为什么呢？

首先使用edgeR算法做一个差异表达分析，这里你可以使用任何一个count矩阵作为数据输入，再加上一个样本分组信息，比如我们前面用的：

生信技能树 6天前2025-11-20 11:58:43

模型、数据、算法、count、list

发表了文章 6天前2025-11-20 11:34:31

一个 pbmc5k的scATAC-seq数据基本分析：snapATAC2软件

我们技能树最新一期生信入门就在11月3号开课，还没上车的可以看一看瞄一瞄，详细介绍页面可以点击：生信入门&数据挖掘线上直播课11月班，完全适合0基础小白。

生信技能树 6天前2025-11-20 11:34:32

对象、函数、软件、数据、存储

发表了文章 6天前2025-11-20 11:34:22

跟着NC杂志文献学习处理scATAC-seq和bulk ATAC-seq数据

本研究通过单细胞分辨率描绘了发育期和成年小鼠肾脏的开放染色质与基因表达图谱。我们发现基因表达高度依赖于远端调控元件（增强子），揭示了肾脏细胞中关键细胞类型特异性...

生信技能树 6天前2025-11-20 11:34:22

数据、算法、数据处理、集合、入门

发表了文章 6天前2025-11-20 11:34:12

（IF=48.8）顶刊杂志的带有超详细python单细胞代码和数据学习的文献分享

这篇文献是一篇极其典范的单细胞python流派的数据分析文章，集合了单细胞数据预处理，数据合并，数据整合，数据注释等工作。跨数据集和大数据量！应该有很多细节值得...

生信技能树 6天前2025-11-20 11:34:13

集合、数据、python、大数据、工作

发表了文章 6天前2025-11-20 11:33:43

一行代码给你的单细胞UMAP图添加左下角小箭头坐标轴

Fig2中的a图：是一幅非常常见的单细胞UMAP散点图，展示了细胞类型注释结果。图用了左下角的小箭头坐标，图例使用的带外圈的小圆点并经过了精细调整。

生信技能树 6天前2025-11-20 11:33:43

cell、data、链表、入门、数据

发表了文章 6天前2025-11-20 11:31:16

这次真的是Y叔的锅了吗：为什么KEGG通路富集结果中的分类有NA呢？

官网：https://www.genome.jp/kegg/pathway.html

生信技能树 6天前2025-11-20 11:31:17

入门、源码、na、函数、基础

发表了文章 6天前2025-11-20 11:31:04

使用python读取疑难杂症的单细胞数据（GSM7870858）

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSM7870858

生信技能树 6天前2025-11-20 11:31:04

系统、python、人工智能、入门、数据

发表了文章 6天前2025-11-20 11:30:42

uniLUNG：目前最全面的人类肺部单细胞图谱（最新发表，2025.11.13）

这里面除了分析方法值得细细考量之外，里面还坚定到了两个很像双细胞的亚群：一个表现为淋巴细胞标记物高表达的单核细胞亚群（命名为Lym-单核细胞），另一个则是富含T...

生信技能树 6天前2025-11-20 11:30:42

入门、数据、队列、解决方案、可视化

12 3 4 5 6 7 8...118 下一页

个人简介

澳门大学 | 在读博士
暂未填写个人简介
数据库 r 语言 html linux 人工智能
暂未填写学校和专业
暂未填写个人网址
中国澳门
加入社区时间：2017-12-13

个人成就

获得 6.8K 次赞同
文章被阅读 4.9M 次

关注了：4关注者：2.6K