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10X空间转录组数据分析重点梳理

空间转录组学 (ST) 技术正迅速成为单细胞 RNA 测序 (scRNAseq) 的延伸，具有以接近单细胞分辨率分析基因表达的潜力，同时保持组织内的...

生信菜鸟团 2022-04-082022-04-08 17:32:14

腾讯云开发者社区、ide

综述-单细胞转录组学分析细胞通讯

细胞间通讯 (Cell–cell communication, CCC) 是受生化信号调节的细胞间相互作用，能够调节单个细胞的生命过程和细胞间关系。过去CCC ...

生信技能树jimmy 2022-04-182022-04-18 14:53:34

cell、communication、na

单细胞时代 || 网络分析应用进展，机遇与挑战

Network modeling of single-cell omics data: challenges, opportunities, and progr...

生信技能树jimmy 2021-03-102021-03-10 14:52:39

数据库、数据结构、sql、linux

Nat. Mach. Intell. | 基于对比学习的方法可快速映射到数百万规模的多模态单细胞图谱

本文介绍由华大基因的汪建和牟峰共同通讯发表在 Nature Machine Intelligence 的研究成果：单细胞数据集规模的不断扩大，对解决扩展的规模、...

DrugOne 2022-11-282022-11-28 17:29:10

编程算法、深度学习、学习方法、数据集成

Biological Psychiatry综述：人脑成像转录组学的最佳实践

现代全脑转录图谱为研究脑组织的分子相关性提供了前所未有的机会，可以使用无创神经成像进行量化。然而，将神经影像学数据与转录组测量相结合并不是直截了当的，需要仔细考...

悦影科技 2023-12-082023-12-08 10:31:19

医疗大健康

Nature | 迁移学习为网络生物学赋能

今天为大家介绍的是来自Christina V. Theodoris和Patrick T. Ellinor团队的一篇基于迁移学习发现关键调控因子和潜在治疗靶标的论...

DrugOne 2023-09-192023-09-19 14:13:44

迁移学习、编码、模型、数据、网络

【Science】万字综述：空间组学将去何方

空间组学被广泛宣称为生命科学的新前沿。这个术语涵盖了一系列技术，承诺将改变生物学的许多领域，并通过同时测量物理组织结构和分子特性，有望彻底革新病理学。尽管这个领...

Chris生命科学小站 2023-08-292023-08-29 19:52:35

工具、解决方案、连接、数据、协议

空间转录组的几个分析要点及经典文献分享

ST最适合回答三种生物问题：首先可以阐明组织的细胞类型组成；第二类问题与细胞相互作用有关；最后可以帮助阐明组织成分之间的分子相互作用。

追风少年i 2023-02-132023-02-13 17:49:40

数据库、sql、访问管理

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