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甲基化芯片的3种bioconductor包有什么区别
数据结构
对象
工具
数据
芯片
但是实际上甲基化芯片才是最高频的产品，在人类研究领域主要是27k, 450k, 850k 以及最新的925k，而成熟的芯片早就有一系列公共资源在Bioconductor网页里面。
生信技能树
2023-11-30
164
0
R语言练习的时候那些内置数据集
数据结构
汽车
可视化
数据
图表
R语言提供了许多内置的数据集，这些数据集可以在学习和练习时使用，帮助你熟悉R的数据分析和可视化操作。以下是一些常用的内置数据集及其简要介绍：
生信技能树
2023-09-04
692
0
多组学数据挖掘结直肠癌的预后与免疫应答潜在的预测标记
数据结构
现在的数据挖掘文章越来越难了吗，本篇文章影响因子只有1分，但是图表内容其实还挺全的，「下面咱们解析一下看看这篇低分文章干了什么」。
生信技能树
2022-12-16
560
0
ggplot的aes和aes_string的差异
https
http
编程算法
网络安全
数据结构
总共是26个基因，它们都是在case 和 control两个分组需要看表达量差异，而且case 和 control两个分组内部都是10个病人。
生信技能树
2022-07-26
1.7K
0
原发肿瘤和转移瘤的哪个多组学层面的差异大?
数据结构
https
网络安全
腾讯云开发者社区
2020年11月的文章《 Integrated Omics of Metastatic Colorectal Cancer》就是多组学肿瘤研究的佼佼者，基于多组学的分析对来自长海医院(中国上海)的146例中国结直肠癌（CRC）的患者，包括70例转移性 CRC (mCRC)患者和76例早期非转移性 CRC (非 mCRC)患者，取样非常丰富：
生信技能树
2022-07-26
404
0
肿瘤异质性研究的天花板（立体空间，单细胞，多组学）
数据结构
可以看到，每个CRC病人都是 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) 样品，被切割成为了24个区块分别去做不同的实验：
生信技能树
2022-06-08
391
0
cytof数据处理工具大比拼
ios
编程算法
linux
数据结构
数据处理
可以看到， 不同工具的开发语言大不一样，其实这样的比较哪怕是告诉我那个MATLAB开发的工具多么的有优势，我也不想去使用，毕竟新学一门语言还是压力有点大。
生信技能树
2022-01-10
1.4K
1
创造示例数据并且同步讲解绘图技巧的资源推荐
数据结构
http
r 语言
html
而且最近看到很多人在朋友圈转发这个： r-graph-gallery ，感觉就这一个网站就可以养活一个公众号了：
生信技能树
2021-09-17
346
0
lncRNA组装流程的软件介绍之Stringtie
linux
数据结构
编程算法
该软件的官网：https://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml。
生信技能树
2021-07-06
1.4K
0
这50个ggplot2现成图表你居然没有从头到尾自己画一遍
编程算法
https
http
网络安全
数据结构
不过，我做不到，我只能做到的是可以绘制出几乎全部的图表的雏形，而且我个人觉得，把ggplot2学习到这个程度就足够了。一张统计图就是从数据到几何对象（点、线、条形等）的图形属性（颜色、形状、大小等）的一个映射。
生信技能树
2021-07-06
1.5K
0
转录组讲师带你读文献-使用siRNA干扰LINC00152前后看结直肠癌表达量差异
数据结构
腾讯云开发者社区
数据库
sql
我在我在04-转录组笔记推文任务列表（半年期）里面安排了6个经典综述和10篇转录组应用文献给大家，可惜愿意沉下心了认真苦学的并不多。（https://share.mubu.com/doc/14uneHKvPg）
生信技能树
2021-05-27
589
0
R语言数据类型和内置数据集那点事
r 语言
数据结构
R的数据结构是数据类型的封装方式，就是怎么把各种数据类型的数据组合起来，储存相同类型的数据的（同质的），储存不同类型的数据的（异质的），
生信技能树
2021-02-03
1.8K
0
R语言里面双层list变成长形数据框
数据结构
list
overlap
韦恩图固然是一种展现方式，可以看到3个样品各自的上下调基因的overlap情况，基本上呢，随机生成的数值它们的overlap不咋地！
生信技能树
2020-11-11
610
0
数据挖掘课程能带给你什么收获
数据挖掘
数据结构
主要是学习到了会创建project啊，之前不会如此高效整理自己的项目....都是直接复制粘贴代码进去，所以各种报错，唉。
生信技能树
2020-08-07
582
0
这样的诊断模型才优秀
数据结构
linux
因为他们是中山大学肿瘤防治中心，所以病人队列不用愁，实验设计也合理，集中于挖掘用于各种癌症的诊断和预后模型，都是DNA甲基化位点。我们以最新的结直肠癌为例，看看他们是如何发现可用于液体活检的特定ctDNA甲基化位点，而且是诊断和预后模型一起搞！
生信技能树
2020-07-02
788
0
R语言公益课程之bioconductor
r 语言
数据结构
编程算法
我们有一个《R语言公益课程之基础绘图》，虽然说绝大部分入门了R语言的朋友，都实际上根本不需要使用R语言的base函数绘图。但是其实这个绘图本身，也是可以有很多玩法。（录屏以及课程资料也是在对应的钉钉群哈，见文末）
生信技能树
2020-05-25
885
0
ggplot2绘图基础功不扎实？看完这5个资源
https
网络安全
编程算法
数据分析
数据结构
能制作这样图表的工具很多， 我比较喜欢ggplot2+AI， 当然，或许有高手可以独立使用ggplot2调整全部图表细节，不过，我做不到。我只能做到的是可以绘制出几乎全部的图表的雏形，而且我个人觉得，把ggplot2学习到这个程度就足够了。
生信技能树
2020-05-14
1.3K
0
使用R包判定CRC稳定的分子亚型（附-中大六院博士后招聘）
数据结构
数据库
sql
大数据
是CRC分子分型领域的权威，提出4个consensus molecular subtypes (CMSs),该研究整合了18个公共数据集,成功的划分成为了稳定的4类：
生信技能树
2019-12-05
1.4K
0
了解一下CRC稳定的分子分型
企业
数据结构
值得一提的是，居然还有 CRC Subtyping Consortium (CRCSC) 这个组织。有趣的是，不同癌症的分子分型的研究程度很不一样！
生信技能树
2019-10-09
1.2K
0
R-了解数据类型
数据结构
基础
数据类型
数据类型 意会最重要，因为我已经过了 被考名词解释 的年纪了 整数型 ###A non-negative integer specifying the desired length. Double values will be coerced to integer: supplying an argument of length other than one is an error. > a<-as.integer(5) > a [1] 5 > class(a) [1] "integer" 数值型 ###
生信技能树
2019-05-23
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