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DoubleHelix

蛋白质互作数据库汇总

Licata L, Briganti L, Peluso D, et al. MINT, the molecular interaction database:...

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R语言数据分析与挖掘(第八章):判别分析(3)——费歇尔(Fisher)判别分析

我们之前介绍了判别分析中,因为判别准则的不同,可分为多种判别分析法。常用的有费歇尔(Fisher)判别分析、贝叶斯(Bayes)判别分析和距离判别分析。在上2篇...

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R语言数据分析与挖掘(第八章):判别分析(2)——贝叶斯(Bayes)判别分析

Bayes判别,它是基于Bayes准则的判别方法,判别指标为定量资料,它的判别规则和最大似然判别、Bayes公式判别相似,都是根据概率大小进行判别,要求各类近似...

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R语言数据分析与挖掘(第八章):判别分析(1)——距离判别法

判别分析是判断个体所属类别的一种多元统计分析方法。它在医学领域有着广泛的应用,主要有疾病诊断、疾病预测和病因学分析。例如,根据病人的症状、生化指标判断病人得的是...

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R语言数据分析与挖掘(第四章):回归分析(2)——多元线性回归

上一篇文章中介绍了一元线性回归(R语言数据分析与挖掘(第四章):回归分析(1)——一元回归分析),然而,在实际操作中,多元性回归会更多见,因为一个响应变量会对应...

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R语言数据分析与挖掘(第四章):回归分析(1)——一元回归分析

回归分析只涉及到两个变量的,称一元回归分析。一元回归的主要任务是从两个相关变量中的一个变量去估计另一个变量,被估计的变量,称因变量,可设为Y;估计出的变量,称自...

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R语言数据分析与挖掘(第一章):数据预处理(3)——数据整理

在介绍了缺失值处理的方法之后,我们可以得到完整的数据集,但在进行数据分析之前,还需要对数据进行整理,下面我们将介绍数据整理的相关知识。

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R语言数据分析与挖掘(第一章):数据预处理(2)——缺失值常用的处理方法

上一篇文章(缺失值处理)介绍了缺失值处理的判断方法,这一讲接着介绍缺失值常用的几种处理方法:删除法,替换法和插补法。不同的方法对应不同类型的缺失值。

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R语言数据分析与挖掘(第一章):数据预处理(1)——缺失值处理

今天开始新的R教程:R语言数据分析与挖掘,本教程是在掌握R基础语法和基本绘图的情况下学习,没有R基础的可先在网上找相关教程进行学习。当然,本公众号(bioinf...

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TCGA数据挖掘(四):表达差异分析(4)

在之前我们的文章:TCGA数据挖掘(三):表达差异分析中,我们利用的是TCGAbiolinks包中的TCGAanalyze_DEA函数进行差异表达分析,我们也提...

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医学生物信息学文献第9期:mTOR信号和细胞代谢是癌症的共同决定因素

癌细胞的生长是由异常信号和代谢重编程所驱动的。癌细胞重新规划其代谢,以确保在缺乏营养和压力的微环境下生存和增殖。代谢变化影响ATP和前体分子的分解代谢途径和生物...

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TUNEL 检测细胞凋亡(附视频)

本教材通过 TUNEL 法检测细胞凋亡, TUNEL,为原位末端转移酶标记技术。 其原理是:先增加细胞膜通透性,让 rTDT 和荧光素生物素标记的 dUTP 进...

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MTT法检测细胞增殖

活细胞线粒体中的琥珀酸脱氢酶能使外源性MTT还原为水不溶性的蓝紫色结晶甲瓒(Formazan)并沉积在细胞中,而死细胞无此功能。二甲基亚砜(DMSO)能溶解细胞...

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免疫组织化学实验

下面是2个视频的中的操作步骤,关于免疫组化,我们之前也发过文章:免疫组化实验,可以进行参考。

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染色质免疫沉淀(ChIP)实验(附视频)

近年来,这种技术得到不断的发展和完善, 帮助研究者判断在细胞核中基因组的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰,也可结合微阵列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活...

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细胞传代实验

实验开始前,将无菌培养瓶、 15ml 离心管、移液管、枪头等放入无菌超净工作台,紫外线照射 30min,以进行工作台的消毒。倒置显微镜下观察细胞形态,确定细胞是...

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细胞侵袭实验

打开 RTCA software, 可看到三个用户权限 ID,本次实验我们用 administrator 登录,密码为小写的 administrator。use...

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细胞冻存实验

实验开始前,将冻存管、 15 毫升离心管、移液管、移液枪、枪头等放入无菌超净工作台,以紫外线照射 30 分钟。采用通风机通风 3 分钟。以 75%酒精擦拭操作台...

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MTT法测细胞增殖和药物毒性实验protocol

活细胞线粒体中的琥珀酸脱氢酶能使外源性MTT还原为水不溶性的蓝紫色结晶甲瓒(Formazan)并沉积在细胞中,而死细胞无此功能。二甲基亚砜(DMSO)能溶解细胞...

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基因编辑新技术——忘记单个基因:CRISPR现在能切割和拼接整个染色体

想象一下一个文字处理器,它允许你改变字母或单词,但当你试图剪切或重新排列整个段落时却犹豫不决。生物学家几十年来一直面临这样的限制。他们可以在细胞中添加或禁用基因...

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