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TCGA数据挖掘(一):TCGAbiolinks包介绍

肿瘤基因组图谱(TCGA)计划是由美国National Cancer Institute(NCI)和National Human Genome Research...

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R语言基础绘图教程——第8章:3维散点图

有时候不知道角度,可以一次绘制多个,选择你觉得合适的图,下面代码会产生一个pdf文件。可以从里面选择最优的一个。

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R语言基础绘图教程——第9章:火山图和QQ图

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PCR中的引物设计

Nucleotide数据库的搜索结果还是比较智能的,搜索结果前面推荐的就是我们的要的,我们做基因检测,做的PCR是定量PCR,设计引物是以基因的转录本为模板设计...

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R语言基础绘图教程——第5章:直方图和柱状图

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R语言基础绘图教程——第6章:箱形图和韦恩图

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R语言基础绘图教程——第7章:小提琴图

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实时定量PCR(RT-qPCR)实验操作流程

一. RT-qPCR 基本原理和概念 实时荧光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次...

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医学生物信息学文献第7期-与侵袭性甲状腺癌进展相关的基因组和转录组特征综合分析

甲状腺癌是最常见的甲状腺恶性肿瘤,约占全身恶性肿瘤的1%,包括乳头状癌、滤泡状癌、未分化癌和髓样癌四种病理类型。未分化甲状腺癌是来源于甲状腺滤泡上皮的未分化肿瘤...

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R语言基础绘图教程——第4章:面积图和饼图

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R语言基础绘图教程——第3章:折线图和带状图

在上一章中我们讲过plot()绘图的基本结构,主要通过type参数来设置绘制图形的类型。

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R语言基础绘图教程——第2章:散点图

plot函数中,x和y分别表示所绘图形的横坐标和纵坐标;函数中的...为附加的参数。

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R语言基础绘图教程——第1章:R语言长用的绘图系统

一般的绘图,base+ggplot2就已经够用了,所以,我们的课程就是以这2个系统进行绘图教学。

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R语言基础教程——第3章:数据结构——数组

数组(array)与矩阵类似,但是维度可以大于2。数组可通过array函数创建,形式如下:

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R语言基础教程——第3章:数据结构——因子

变量可归结为名义型、有序型或连续型变量。名义型变量是没有顺序之分的类别变量。类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子(factor)。因子在R中...

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R语言基础教程——第六章:函数

一个函数是组合在一起以执行特定任务的一组语句。R具有大量内置函数,当然用户也可以创建自己的功能。

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R语言基础教程——第7章:面向对象编程(S4类)

在S3对象中,一般我使用$来访问一个对象的属性,但在S4对象中,我们只能使用@来访问一个对象的属性

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R语言基础教程——第3章:数据结构综合运用

在之前R语言基础教程——第3章:数据结构——向量中我们介绍过向量的加减乘除运算,在这里介绍一下>,<运算。

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R语言基础教程——第3章:数据结构——向量

向量是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。执行组合功能的函数c()可用来创建向量。各类向量如下例所示:

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R语言基础教程——第3章:数据结构——数据框

由于不同的列可以包含不同模式(数值型、字符型等)的数据,数据框的概念较矩阵来说更为一般。它与你通常在SAS、SPSS和Stata中看到的数据集类似。数据框将是你...

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