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  • R绘图笔记 | 散点分布图与柱形分布图

    https://docs.qq.com/sheet/DV0dxREV1YkJ0ZmVj

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  • R绘图笔记 | 二维散点图与统计直方图组合

    前面介绍了散点图、柱状图、直方图和核密度估计图,有时候散点图不能很直观的看的出数据的分布情况,这里介绍散点图与统计直方图组合绘制。

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  • cBioPortal数据库使用教程

    大规模的癌症基因组计划,比如The cancer genome atlas(TCGA) and the International cancer genome ...

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    数据库SQL
  • Linux笔记【005】| vim编辑器使用教程

    Vim是Linux下一款编辑器软件,它的地位等同于windows下的notepad(记事本)。其功能上要比windows的记事本要强上很多倍,这个vim在开发行...

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  • R绘图笔记 | 柱状图绘制

    绘图:geom_bar用于绘制柱状图,ylim设置纵轴值范围,them设置主题,axis.title设置坐标轴名称参数,axis.text设置坐标轴参数。

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  • R绘图笔记 | 一般的散点图绘制

    plot函数中,x和y分别表示所绘图形的横坐标和纵坐标;函数中的...为附加的参数。plot函数默认的使用格式如下:

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  • Linux笔记【004】| 文件/文件夹的基本操作命令

    如果后面的参数文件名指定了路径,则表示在指定的路径下创建;如果只是传递一个文件名,则表示在当前目录创建文件。

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  • 单细胞测序技术原理

    2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现,彻底降低了单细胞测序的成本门槛。

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  • Linux笔记【001】| 初识Linux

    Linux 内核最初只是由芬兰人林纳斯·托瓦兹(Linus Torvalds)在赫尔辛基大学上学时出于个人爱好而编写的。

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  • Linux笔记【002】| 远程登录服务器软件:MobXterm与FileZilla

    在实际开发或者计算的时候可以使用一些第三方的工具对远程的服务器进行控制。目前常用的Linux远程登录工具有:putty、xshell、secureCRT等等。我...

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  • Linux笔记【003】| Linux系统目录结构与基本命令

    linux的文件系统是采用级层式的树状目录结构,在此结构中最上层是根目录“/”,然后在此目录下再创建其它的目录。在linux世界里。一切皆文件。

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  • 纯生信也能发到18分!这个预后型Biomarker套路,感觉没什么难度!

    我们都知道癌症的特点是不同的基因改变积累,导致癌细胞表面出现不同的新抗原表达。人体免疫系统是机体发现和消灭肿瘤细胞的可靠“人体警察”。然而,肿瘤细胞可以利用机体...

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  • PanGPCR | 预测多个潜在的GPCR靶标及其在组织中的表达位置,副作用以及GPCR药物的可能用途

    靶向G蛋白偶联受体(GPCR)(已知的最大治疗靶标)的药物发现具有挑战性。为了促进GPCR药物的快速发现和开发,Yufeng J Tseng等人构建了PanGP...

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  • biomaRt包实现不同物种之间同源基因转换

    ,约80%的小鼠蛋白质在人类基因组中具有严格的1:1种间同源体,其序列同一性通常介于70%~100%。当然跟人类亲缘关系最近的物种是黑猩猩。

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  • 转录组分析 | fastqc进行质控与结果解读

    做转录组测序,通常公司是不给分析的,分析也要自己多花钱,当然不同公司收费不一样,有的可能带有简单的分析。之前测序的第一家公司给了简单的分析,后面换了一家测序公司...

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  • 转录组分析 | 使用trim-galore去除低质量的reads和adaptor

    我前面已经介绍了转录组分析中利用fastqc这个软件来查看测序质量【文章:转录组分析 | fastqc进行质控与结果解读】,通过分析结果报告,我测序的数据还是可...

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  • 转录组分析 | 使用Hisat2进行序列比对

    转录组分析 | 使用trim-galore去除低质量的reads和adaptor

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  • 转录组分析 | 使用SAMtools将SAM文件转换为BAM文件、排序、建立索引

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  • 转录组分析 | 使用Stringtie对数据进行下游处理

    StringTie 是用于 RNA-seq 的转录本组装和定量软件,StringTie 可以看做是cufflinks软件的升级版本,其功能和Cufflinks是...

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  • 转录组分析 | 使用RSeQC软件对生成的BAM文件进行质控

    RSeQC是发表于2012年的一个RNA-Seq质控工具,属于python包。它提供了一系列有用的小工具能够评估高通量测序尤其是RNA-seq数据,比如一些基本...

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