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分子结构预测新型多模态基础模型｜Chai完成3000万美元融资，OpenAI参投
人工智能
chai
openai
基础
模型
2024年9月，人工智能生物学初创公司Chai Discovery宣布从重量级公司Thrive Capital和OpenAI那里筹集了近3000万美元，用于将人工智能引入药物发现。
智药邦
2024-09-18
95
0
清华大学刘知远团队提出ChatMol模型，基于自然语言进行交互式的分子发现
系统
数据库
模型
设计
数据
在大语言模型时代，自然语言将成为人机交互的关键媒介。在生物化学领域，诸如性质预测和分子挖掘等任务至关重要，但在技术上具有挑战性。在自然语言和化学语言中架起分子表达的桥梁可以显著提高这些语言的可解释性和易用性，整合各种来源的化学知识，从而更深入地了解分子。
智药邦
2024-09-18
90
0
Drug Discov Today｜当前基于结构的药物设计面临的7大挑战
工具
设计
数据
优化
数据库
2024年9月，查尔斯河实验室CADD领域高级研究负责人David E. Clark等人在Drug Discovery Today上发表综述Caught between a ROCK and a hard place: current challenges in structure-based drug design。
智药邦
2024-09-13
100
0
中山大学杨跃东团队提出MUSE模型，通过变分期望最大化框架预测蛋白质和药物相互作用
数据
网络
优化
框架
模型
了解蛋白质与蛋白质、药物和其他生物分子的相互作用，对于破译生物学过程背后的分子机制和开发新的治疗策略至关重要。
智药邦
2024-09-12
100
0
DeepMind发布蛋白质AI设计系统AlphaProteo
测试
工具
开发
设计
系统
2024年9月5日，DeepMind发布AlphaProteo，这是其首个用于设计新型高强度蛋白质结合物的人工智能系统，可作为生物和健康研究的基石。
智药邦
2024-09-12
101
0
湖南大学团队提出APN模型，通过属性引导的原型网络实现分子性质预测
监督学习
模型
数据
网络
原型
分子性质预测(MPP)在药物发现过程中起着至关重要的作用，为分子评价和筛选提供了有价值的见解。尽管深度学习在这一领域取得了许多进展，但它的成功往往取决于大量标记数据的可用性。与之相比，小样本MPP是一个更具挑战性的场景，其目的是用很少的可用分子来识别未知的分子特性。在药物发现任务中，分子数据由于难以收集、预处理和标记，面临着数据稀缺性的挑战，因此，小样本学习已成为一种该领域广受关注的解决方案。越来越多的小样本学习算法结合元学习策略，在药物分子性质预测的训练阶段从大量与测试任务相似的任务中学习经验或先验知识，使其能够快速适应给定多个标记数据的测试任务，实现更精准的分子性质预测。
智药邦
2024-09-02
175
0
南开大学提出PGAT-ABPp模型，通过蛋白质语言模型和图注意力网络识别抗菌肽
数据
网络
性能
模型
设计
耐药病原体的出现是对人类健康的巨大挑战。抗菌肽(Antimicrobial peptides，ABP)又称宿主防御肽，是机体免疫防御系统的重要组成部分，表现出多方面的作用机制，对细菌、真菌、病毒和其他病原体具有广谱抗菌活性。因此，它们已成为传统抗菌药物的潜在替代品。然而，识别ABP需要复杂的设计、漫长的筛选周期和严格的条件，这使得大规模筛选非常具有挑战性。
智药邦
2024-08-29
104
0
Nat Biotechnol｜基于机器学习的功能性蛋白质设计的进展
优化
机器学习
nat
模型
设计
近年来，由于机器学习的发展与蛋白质序列和结构数据的积累，蛋白质设计发生了巨大的革新。这些由于技术革新而产生的新方法有望突破自然和实验进化的限制，加速生成用于生物技术和医学的功能性蛋白质。
智药邦
2024-08-29
87
0
Nat Methods｜在计算生物学中应用可解释机器学习--陷阱、建议和新机遇
机器学习
nat
methods
模型
设计
机器学习，尤其是深度学习的最新进展，为计算生物学中的复杂问题提供了强大的预测模型。然而，随着模型复杂性的增加，解释这些模型的行为变得尤为重要。
智药邦
2024-08-29
122
0
Paige推出世界上最大的AI病理模型，重新定义癌症的诊断和治疗
模型
数据
人工智能
基础
开发
2024年8月8日，癌症临床人工智能应用领域的全球领先企业Paige与微软合作，推出了第二代Virchow--百万级癌症基础模型。
智药邦
2024-08-29
125
0
Nat Methods｜下一代人工智能在连接组学中的应用
模型
人工智能
nat
methods
连接
2024年8月9日，Nature Methods推出特刊《Embedding AI in biology》，重点介绍了创新的新方法（如生成式人工智能和大型语言模型）的卓越能力和快速发展，和各自领域思想领袖的观点。
智药邦
2024-08-29
126
0
AI+类器官芯片赋能新药研发｜耀速科技完成亿元级天使+轮融资
科技
模型
芯片
研发
行业
耀速科技（Xellar Biosystems）近日宣布完成亿元级人民币天使+轮融资。该轮融资由鼎泰集团（TriApex） 领投，正轩投资、天图投资跟投，老股东君联资本与雅亿资本持续加注。本轮融资将助力耀速科技进一步开发AI+类器官芯片技术平台，推动在新药研发领域的深度应用。
智药邦
2024-08-21
135
0
Nat Methods｜生物学研究语言模型：简化版入门指南
模型
入门
数据
nat
methods
2024年8月9日，Nature Methods推出特刊《Embedding AI in biology》，重点介绍了创新的新方法（如生成式人工智能和大型语言模型）的卓越能力和快速发展，和各自领域思想领袖的观点。
智药邦
2024-08-21
126
0
吉林大学提出PGR-MOOD模型，通过扩散模型检测分布外的分子图
性能
原型
重构
模型
数据
尽管分子表示学习最近取得了显著进展，但其有效性是建立在训练图和测试图来自相同分布的假设上的。而在实际应用中，测试数据集通常与分布外(OOD)样本混合在一起，使得部署的模型难以做出准确的预测。在药物筛选或设计中对分子性质的错误估计会导致湿实验室资源的巨大浪费，并延迟新疗法的发现。传统的检测方法需要权衡OOD检测和分布内(ID)分类性能，因为它们共享相同的表示学习模型，这就降低了模型检测OOD样本的性能。相比之下，由于生成模型偏向于重建分布内（in-distribution，ID）训练样本，因此，生成模型可以使得OOD分子与现有分子的相似度降低，从而便于检测出OOD分子。
智药邦
2024-08-20
112
0
Nat Methods推出特刊｜关注生物学中的高级人工智能
人工智能
nat
methods
模型
数据
2024年8月9日，Nature Methods推出特刊《Focus on advanced AI in biology》，介绍了基于人工智能的先进方法如何正在对生物学研究产生变革性影响。
智药邦
2024-08-14
169
0
香港科技大学提出DualNetGO模型，通过高效的特征选择对偶网络预测蛋白质功能
网络
性能
函数
模型
数据
蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络是自动标注蛋白质功能的关键。由于同一组蛋白质存在多个PPI网络，这些网络从不同方面捕获特性，因此有效利用这些异构网络是一项具有挑战性的任务。最近，一些深度学习模型结合了PPI网络，将网络上的图嵌入连接起来用于蛋白质功能预测。然而，由于不同PPI网络的密度、结构和噪声水平各不相同，不加选择地结合蛋白质特征会增加噪声水平，导致模型性能下降。可以说，高效的特征选择程序的缺乏，阻碍了对不同PPI网络信息的有效利用。
智药邦
2024-08-13
88
0
Science｜新的AI工具可以确定小分子的结构，即使数据参差不齐
数据
人工智能
编码
测试
工具
人工智能已经通过预测蛋白质的三维结构彻底改变了蛋白质的研究。现在，人工智能开始对更小的分子发挥威力--药物、除草剂和催化剂，它们是医药、农业和工业化学的核心。
智药邦
2024-08-09
126
0
耶鲁大学提出分子语言模型MolLM，结合生物医学文本与分子的二维和三维表示
模型
数据
数据库
编码
论文
目前用于分子和文本联合表示的深度学习模型主要依赖于一维或二维分子格式，而忽略了提供有价值的物理见解的重要三维结构信息，因此限制了模型在广泛的模态范围内的多功能性和适应性。相反，专注于明确的三维表示的有限研究往往忽略了生物医学领域内的文本数据。因此，将二维和三维分子信息以及生物医学文本相结合的分子表示学习模型仍十分缺乏。
智药邦
2024-08-07
130
0
Science博客｜AI能否解决临床数据问题？
数据
算法
人工智能
博客
工具
2024年6月27日，来自布列根和妇女医院的Daniel Barron和哈佛医学院的Xiang Li、Quanzheng Li在Science发表评论：Can AI solve the clinical data problem?
智药邦
2024-08-07
85
0
Nature子刊｜AlphaFold3：向解码分子行为和生物计算迈出的一步
架构
模型
设计
数据
研发
在生物科学的广阔领域中，理解生物分子的三维结构及其相互作用是揭示生命奥秘的关键步骤。近年来，随着人工智能和机器学习的飞速发展，科学家们在这一领域取得了突破性进展。其中，AlphaFold3的问世尤为引人注目，它不仅能够预测单个生物分子的三维结构，还能准确预测生物分子复合物的结构，为解码分子行为和生物计算提供了强有力的工具。
智药邦
2024-08-05
131
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