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#pca

深入理解PCA:奇异值分解与主成分的统计可解释性

用户6320865

主成分分析(Principal Component Analysis, PCA)作为多元统计分析的基石性方法,其核心思想可以追溯到20世纪初的数学探索。1901...

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吴恩达机器学习 - PCA算法降维

FishWang

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PCA多变量离群点检测:Hotelling's T2与SPE方法原理及应用指南

deephub

主成分分析(Principal Component Analysis, PCA)作为一种经典的无监督降维技术,在保留数据主要信息的同时能够有效压缩数据维度。由于...

12010

DROPP算法详解:专为时间序列和空间数据优化的PCA降维方案

deephub

DROPP (Dimensionality Reduction for Ordered Points via PCA) 是一种专门针对有序数据的降维方法。本文将...

8210

[python]texthero安装后测试代码

云未归来

测试代码来自官方:https://github.com/jbesomi/texthero

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做单细胞和空转必须了解的AnnData数据结构

生信技能树

图解如下:https://anndata.readthedocs.io/en/stable/index.html

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PCA(主成分分析)进行特征降维定义及java实现例子

jack.yang

PCA(Principal Component Analysis,主成分分析)是一种常用的数据分析方法,用于在尽可能多地保留数据集中对方差贡献最大的特征的同时降...

19810

R语言中的主成分方法:PCA分析和可视化实用指南

简说基因

个体的结果可以使用函数 get_pca_ind() factoextra package提取。与 get_pca_var() 类似,函数 get_pca_ind...

1.3K11

通过选科,体育赛事,优秀论文多维度带你了解主成分分析PCA(附Python代码)

阑梦清川

主成分分析法,是我们在学习这个数学建模的时候应该是经常接触的一个方法了,反正自从我大一开始了解这个数学建模的相关知识,已经学了好几遍这个方法了,随着自己的经历的...

13110

基因型数据进行PCA分析是否提前对LD进行质控

邓飞

之前我总是认为,基因型数据对PCA分析,不需要进行LD质控,因为PCA构建需要先计算G矩阵(基因型数据绘制PCA图和聚类分析图),而G矩阵依赖LD,原则上SNP...

15110

群体遗传三剑客第一篇:分组和不分组的PCA分析,添加解释百分比

邓飞

之前,准备写一下群体遗传分析三剑客(搞起来!群体遗传三剑客:PCA、Admixture、进化树),第一篇来啦!

47010

《人工智能之高维数据降维算法:PCA与LDA深度剖析》

程序员阿伟

在人工智能与机器学习蓬勃发展的当下,数据处理成为关键环节。高维数据在带来丰富信息的同时,也引入了计算复杂度高、过拟合风险增大以及数据稀疏性等难题。降维算法应运而...

29710

搞起来!群体遗传三剑客:PCA、Admixture、进化树

邓飞

群体遗传学中常用的三大分析工具:主成分分析(PCA)、Admixture分析和进化树(Phylogenetic Tree),它们在分析基因型数据时各有侧重,互为...

1.1K10

一步一个坑:单细胞数据的h5ad格式转换成R可读取对象

生信技能树

随手一搜,找到一个帖子:https://zhuanlan.zhihu.com/p/12861008987#:~:text=%E4%BD%BF%E7%94%A8%...

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R语言主成分PCA、因子分析、聚类对地区经济研究分析重庆市经济指标

拓端

建立重庆市经济指标发展体系,以重庆市一小时经济圈作为样本,运用因子分析方法进行实证分析,在借鉴了相关评价理论和评价方法的基础上,本文提取出经济规模、人均发展水平...

12810

PCA没有明显分层GWAS分析还用考虑吗?

邓飞

大家好,我是邓飞,最近星球的小伙伴问了一个问题,PCA图显示没有明显的分层,K值也没有明显拐点,GWAS分析还用考虑吗?PCA图如下:

17710

R语言主成分分析(PCA)葡萄酒可视化:主成分得分散点图和载荷图

拓端

数据包含177个样本和13个变量的数据框;vintages包含类标签。这些数据是对生长在意大利同一地区但来自三个不同栽培品种的葡萄酒进行化学分析的结果:内比奥罗...

19910

公司标准分析报告如何发Q1且IF 5+文章?

生信技能树

取样为 来自 自5个妊娠期糖尿病患者和匹配的5个对照组的皮下和大网膜脂肪组织(AT),展示了这10个patient的一些年龄、BMI、胰岛素等指标。

12810

在什么情况下癌症样本与正常样本是分不开的呢?

生信技能树

今天遇到的数据集合为:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54236,数据情况如下:

12010

Python时空图神经网络ST-GNNs-PCA嵌入交通数据预测可视化及KPCA核主成分分析汽油精制应用实例

拓端

本研究横跨交通预测与汽油精制两大领域,PCA 嵌入在其中均扮演着核心角色,我们旨在通过深入探索与研究,全面展示 PCA 嵌入在不同复杂系统中的卓越性能与广泛应用...

27810
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