用户7592569

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综述:团簇结构全局优化的方法、应用和挑战

本文用笔记的形式介绍团簇结构全局优化软件ABCluster(点击文末“阅读原文”可进入程序下载页面)的作者Jun Zhang在Int. J. Quantum C...

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从密度矩阵产生自然轨道_实战篇(上)

本公众号之前发过自然轨道的原理介绍,详见《从密度矩阵产生自然轨道-理论篇》和《S^(1/2)的一些性质》。对其中原理和公式熟悉的读者,可以自己编写代码从密度矩阵...

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用Gaissian16中的GIC功能实现翻转过程的势能面扫描

势能面扫描前需要用户对扫描坐标有一个明确的定义。在Gaussian 16的广义内坐标(GIC)功能出现之前,我们只能对一些简单的结构参数,如笛卡尔坐标、键长、键...

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计算强相关体系的量子化学新方法

近日,南京大学的黎书华教授课题组提出并在从头算水平上实现了以广义价键(GVB)波函数为参考态的块相关耦合簇(简记为GVB-BCCC)方法,为强相关体系的电子结构...

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一种用Gaussian 16中的GIC功能实现同时扫描多个坐标的方法

势能面扫描是我们用Gaussian常做的计算,一般可以分为刚性扫描和柔性扫描。如果在柔性扫描中给定两个坐标,那么我们将会得到二维势能面。但是有时候我们只希望两个...

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用Gaussian寻找圆锥交叉点

圆锥交叉(conical intersection, CI)简言之是指两个态的势能面交叉的地方,此时两个态的能量简并。在圆锥交叉区域,体系可以从激发态以无辐射形...

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用Gaussian 16计算振动分辨的紫外-可见吸收光谱

分子在电子态之间的跃迁是极其快速的过程(飞秒量级),比分子的振动周期(皮秒量级)快得多。因此,在电子态跃迁的瞬间,分子中原子核的运动可认为跟不上电子态的变化,分...

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用Gaussian做CASSCF计算

完全活性空间自洽场(complete active space self-consistent field, CASSCF)是一种组态相互作用(configur...

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Kuhn-Munkres配对算法

生活或工作中,我们常常碰到分配问题。比如公司有n个任务,由n个工人来做,每个工人不同程度地擅长一个或几个任务。如果你是管理层,如何布置任务最大程度地发挥大家所长...

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RMSD计算中的Kabsch算法简介

RMSD即均方根偏差(root mean square deviation)。设有两组向量P和Q,每组向量有N个维度为D的向量,因此P和Q可以看做N×D矩阵,那...

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在Gaussian16中同时扫描两个反应坐标

是依次扫描两个坐标,无法做到同时,因此得到的是一张二维势能面,总扫描点数是两个坐标扫描点数的乘积,计算量较大。然而有时候我们只想同时扫描两个反应坐标,即两个坐标...

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用高斯计算磷光发射能

磷光的产生原理同样可用以下Jablonski能级图来描述。分子吸收电磁辐射后处于激发态,若S1的振动能级与T1的振动能级重叠,则可能发生系间窜跃(intersy...

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用于研究反应活性和选择性的Distortion/Interaction-Activation Strain模型

Activation strain model或者distortion/interaction model是一种能量分解的方式,最早由F. Matthias B...

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【双清论坛】国内计算化学方法与软件开发(Ⅱ)

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激发态计算中的溶剂效应

已经有不少小伙伴在催更,非常感谢大家的支持,也有了更新的动力。关于隐式溶剂模型的介绍,可参见《理论计算中的溶剂效应模型》一文。本文着重介绍在激发态计算中使用隐式...

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Linux下远程工作防掉线的一个办法

不少小伙伴疫情期间在家会用Teamviewer远程工作。笔者来自南大,南大的网络每个月会自动logout,或者有些单位的网络一段时间无活动会自动掉线,或者一些不...

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S^(1/2)的一些性质

  本文所述为量子化学电子结构理论中的基础知识,为本公众号同期另一文《从密度矩阵产生自然轨道_理论篇》一文的补充,对此基础内容熟悉的读者可以直接略过。

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量子化学进入机器学习时代

有“机器学习教父”之称的CMU教授Tom Mitchell曾给出过机器学习的经典定义:假设用P来评估计算机程序在某任务类T上的性能,若一个程序通过利用经验E在T...

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用Gaussian 16做二分量赝势自旋轨道DFT(SODFT)计算

能够做二分量赝势SODFT计算的程序里[1],用的比较多的大概就是“西北大学化学系”[2]和“淘宝猫”[3]了,因为这两个程序的SODFT都有解析梯度,能够做结...

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从密度矩阵产生自然轨道-理论篇

  对于一个单或多行列式波函数方法(例如RHF, MP2, CCSD, CASCI, CASSCF等等),可将电荷密度(charge density)

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